COVID19に関する私見（3／16）
SARS-CoV-2は総感染数が大きく根絶は困難で越年性があると思う。インフルエンザが一つ増える感じだろうか。若年者や持病のない者には重症化が少ないという安堵できる点はあるが、高年以上の者、持病のある者は要注意だ。肺外臓器障害も分かってきた。感染性や重症化におけるウイルス粒子とRNAダブルストランドとの機能差、体内移動などのメカニズムは未解明である。治療薬や予防薬は開発中だがまだ決め手はない。創薬テクニックは進んでいるので、計算機（AIともいう）の力を活用すれば既存薬の活用も有望である。重症者にはECMOが有効でエラスポールなど既存薬の選択肢も出てきている。抗体検査が普及すれば、検査センターでのドライブスルー型の受診も可能かもしれない。そこでは、保険証や免許証などの自己証明書や、発熱体調などの有症状記録の呈示と、高齢者や抗免疫薬投与者、合併症を持っている者に感染させない為の誓約書（現状は自宅隔離静養）も必要になる。
後出しじゃんけんで今では何とでもいえるが、多くの現場医療者、報告者の努力に敬意を示したい。
これからは鎖国新時代を迎えると2／24に書き込んだが、今の時点でその予感は少し薄くなっている。しかし、国境の防御体制、集会・通勤利用時の注意点などが大きく変わることは間違いなさそうだ
3／14
First Case of COVID-19 Infection with Fulminant Myocarditis Complication: Case Report and Insights
https://www.preprints.org/manuscript/202003.0180/v1
背景：コロナウイルス病2019（COVID-19）は肺炎の原因として実証されています。それにもかかわらず、それは急性心筋炎または劇症心筋炎の原因として報告されていません。症例の提示：63歳の男性が肺炎と心臓症状を認めた。彼は入院初日にtestingを検査することによりCOVID-19として遺伝的に確認されました。また、彼は、トロポニン-I（Trop I）レベルが上昇し、心エコー検査で左室駆出率（LVEF）の低下とともに心筋のジスキネジアが拡散しました。インターロイキン6の最高レベルは272.40pg / mlでした。ベッドサイド胸部レントゲン写真では、ウイルス性肺炎の典型的なすりガラス状の変化が認められました。心筋炎を引き起こす可能性のあるウイルスの臨床検査結果はすべて陰性です。患者は劇症心筋炎に対する中国の専門家のコンセンサス声明の診断基準に適合しました。抗ウイルス療法と機械的生命維持を受けた後、Trop Iは0.10 g / Lに減少し、インターロイキン6は7.63 pg / mlでした。一方、患者のLVEFは徐々に回復して68％になりました。結論：COVID-19患者は、心筋炎や心不全などの重篤な心臓合併症を発症する可能性があり、これは劇症心筋炎を合併したCOVID-19感染症の最初の症例です。 COVID-19によって引き起こされる心臓病理のメカニズムは、さらなる研究が必要です。
3／14
Prognostic value of NT-proBNP in patients with severe COVID-19
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.07.20031575v1.full.pdf
medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.07.20031575.
概要
中国での重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）に起因するコロナウイルス病2019（COVID-19）の発生は、国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態であると宣言されています。 その過程で心臓損傷が支配的でした。 しかし、N末端プロB型ナトリウム利尿ペプチド（NT-proBNP）がCOVID-19患者の転帰を予測するかどうかは不明でした。 この研究では、継続的なサンプルから、重度のCOVID-19肺炎の患者102人が最初に登録されました。 不適格な症例を選別した後、54人の患者がこの研究で分析されました。 その結果、NT-proBNP（88.64 pg / mL以上）のレベルが高い患者は、院内死亡のリスクが高いことがわかりました。 NT-proBNPは、別々のモードで潜在的な共創者を調整した後、重度のCOVID-19患者の院内死亡の独立した危険因子として提示されました。
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.07.20031575v1.full.pdf
medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.07.20031575.
概要
中国での重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）に起因するコロナウイルス病2019（COVID-19）の発生は、国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態であると宣言されています。 その過程で心臓損傷が支配的でした。 しかし、N末端プロB型ナトリウム利尿ペプチド（NT-proBNP）がCOVID-19患者の転帰を予測するかどうかは不明でした。 この研究では、継続的なサンプルから、重度のCOVID-19肺炎の患者102人が最初に登録されました。 不適格な症例を選別した後、54人の患者がこの研究で分析されました。 その結果、NT-proBNP（88.64 pg / mL以上）のレベルが高い患者は、院内死亡のリスクが高いことがわかりました。 NT-proBNPは、別々のモードで潜在的な共創者を調整した後、重度のCOVID-19患者の院内死亡の独立した危険因子として提示されました。
以前の研究では、NT-proBNPは市中肺炎（CAP）7-9の死亡率の強力かつ独立した予測因子であることがわかっています。これらの研究では、30日間の死亡率を予測するためのNT-proBNPの最適なカットオフは、それぞれ1,434.5 pg / mLと1,795.5 pg / mL7,9でした。これらの症例でのNT-proBNPの上昇は、既存の状態、相対的な虚血、交感神経系の上方制御、全身性炎症、および心血管系への直接的な病原体媒介性損傷の複雑な相互作用に起因する心臓合併症によると考えられていました10。
しかし、現在の研究では、重度のCOVID-19患者の有害転帰を予測するためのNT-proBNPのカットオフ値は、心不全を診断するための閾値よりもはるかに低かった（50歳未満で450 pg / mL、50歳で900 pg / mL -75年、および75年以上で1,800 pg / mL）11。重度のCOVID-19患者における血漿NT-proBNPの予後効果は、ウイルスによって誘発された心不全に完全に帰することができないことが示唆されました
または低酸素。重度のCOVID-19患者における血漿NT-proBNP上昇の生理学的および病理学的重要性をさらに理解することで、臨床医は対応する意思決定を行い、有害な結果のリスクを減らすことができます。
NT-proBNPの予後効果は、心臓のストレスと炎症の程度を示している可能性があります。以前の報告は、新しいコロナ肺炎の重症患者の心臓損傷は非常に顕著であり、心臓死はCOVID-195,6の患者の重要な死因になっていることを指摘しています。 COVID-19に関連した心臓損傷のメカニズムはまだ不明でした。 Xuと同僚による剖検の結果から、心臓生検でいくつかの間質性単核炎症性浸潤が観察され、これは炎症誘発性の心臓損傷を示しています12。 アンジオテンシン変換酵素関連カルボキシペプチダーゼ（ACE2）13の結合部位を介したSARSCoV-2感染および浸潤心筋細胞を含む他の要因13、肺感染は心筋への不十分な酸素供給を誘発し、サイトカインストーム症候群14-16の心臓損傷17への影響に寄与します
現在の研究では、NT-proBNPは、心臓損傷および全身性炎症のメーカーと正の相関がありました。心臓損傷と炎症のレベルは、単変量Cox比例ハザード回帰分析による院内死亡のリスクも示しました。ただし、重回帰分析では、NT-proBNPの影響下での院内死亡のハザード比と心臓損傷マーカーは関連していませんでした。
NT-proBNPと炎症の両方が、院内死を予測する独立した効果を示しました。これらを考慮すると、NT-proBNPの予後効果は、生物の全体的な状態を反映する包括的な指標になる可能性があります。
SARS-CoV-2はACE2と結合し、アンジオテンシン2（ANGII）の制御されない放出とANG1-718の合成の制限をもたらします。後者は抗炎症効果を発揮して組織を保護しますが、ANGIIは反対の役割を果たし、NT-proBNP18-20の分泌を促進します。
最前線の医師は、重度のCOVID-19肺炎の一部の非生存者が警告なしに死亡したことを指摘しました。入院時の重症COVID-19患者のNP-proBNPレベルの予後効果を調査することにより、予後不良の患者を早期に特定するのに役立つ可能性があります。
しかし、現在の研究では、重度のCOVID-19患者の有害転帰を予測するためのNT-proBNPのカットオフ値は、心不全を診断するための閾値よりもはるかに低かった（50歳未満で450 pg / mL、50歳で900 pg / mL -75年、および75年以上で1,800 pg / mL）11。重度のCOVID-19患者における血漿NT-proBNPの予後効果は、ウイルスによって誘発された心不全に完全に帰することができないことが示唆されました
または低酸素。重度のCOVID-19患者における血漿NT-proBNP上昇の生理学的および病理学的重要性をさらに理解することで、臨床医は対応する意思決定を行い、有害な結果のリスクを減らすことができます。
NT-proBNPの予後効果は、心臓のストレスと炎症の程度を示している可能性があります。以前の報告は、新しいコロナ肺炎の重症患者の心臓損傷は非常に顕著であり、心臓死はCOVID-195,6の患者の重要な死因になっていることを指摘しています。 COVID-19に関連した心臓損傷のメカニズムはまだ不明でした。 Xuと同僚による剖検の結果から、心臓生検でいくつかの間質性単核炎症性浸潤が観察され、これは炎症誘発性の心臓損傷を示しています12。 アンジオテンシン変換酵素関連カルボキシペプチダーゼ（ACE2）13の結合部位を介したSARSCoV-2感染および浸潤心筋細胞を含む他の要因13、肺感染は心筋への不十分な酸素供給を誘発し、サイトカインストーム症候群14-16の心臓損傷17への影響に寄与します
現在の研究では、NT-proBNPは、心臓損傷および全身性炎症のメーカーと正の相関がありました。心臓損傷と炎症のレベルは、単変量Cox比例ハザード回帰分析による院内死亡のリスクも示しました。ただし、重回帰分析では、NT-proBNPの影響下での院内死亡のハザード比と心臓損傷マーカーは関連していませんでした。
NT-proBNPと炎症の両方が、院内死を予測する独立した効果を示しました。これらを考慮すると、NT-proBNPの予後効果は、生物の全体的な状態を反映する包括的な指標になる可能性があります。
SARS-CoV-2はACE2と結合し、アンジオテンシン2（ANGII）の制御されない放出とANG1-718の合成の制限をもたらします。後者は抗炎症効果を発揮して組織を保護しますが、ANGIIは反対の役割を果たし、NT-proBNP18-20の分泌を促進します。
最前線の医師は、重度のCOVID-19肺炎の一部の非生存者が警告なしに死亡したことを指摘しました。入院時の重症COVID-19患者のNP-proBNPレベルの予後効果を調査することにより、予後不良の患者を早期に特定するのに役立つ可能性があります。
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Diagnosis of Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Infection by Detection of Nucleocapsid Protein
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.07.20032524v2.full.pdf
medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.07.20032524.
概要
バックグラウンド
核酸検査と抗体アッセイはSARS-CoV-2感染の診断に使用されていますが、診断のためのウイルス抗原の使用は成功裏に開発されていません。理論的には、ウイルス抗原はウイルスの特異的なマーカーであり、感染集団内での抗体の出現に先行します。迅速かつ早期の診断のために、ウイルス抗原を検出する必要があることは明らかです。
方法
本研究では、7つのセンターからSARS-CoV-2感染が疑われる239名の参加者のコホートを含めました。核酸検査と並行して、鼻咽頭スワブサンプルのヌクレオカプシドタンパク質を測定しました。核酸検査は参照標準として採用され、統計的評価は盲検下で実施されました。別のセンターの20個の尿サンプルでヌクレオカプシドタンパク質を検出し、鼻咽頭スワブ核酸検査を参照標準として使用しました。
結果
鼻咽頭スワブサンプルおよび尿中のSARS-CoV-2のヌクレオカプシドタンパク質を10分以内に検出するための蛍光免疫クロマトグラフィーアッセイを開発しました。ヌクレオカプシドタンパク質陽性および陰性参加者の100％は、同じサンプルの核酸検査に一致しています。さらに、3日間の発熱後の最も早い参加者をこの方法で特定できます。追加の予備研究では、診断されたCOVID-19患者の73.6％で尿中にヌクレオカプシドタンパク質が検出されました。結論これらの発見は、ヌクレオカプシドタンパク質アッセイが、COVID-19の診断のための正確、迅速、早期かつ簡単な方法であることを示しています。尿中のヌクレオカプシドタンパク質の出現は、腎臓に侵入しているSARS-CoV-2の発見と一致し、診断的価値がある可能性があります。
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.07.20032524v2.full.pdf
medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.07.20032524.
概要
バックグラウンド
核酸検査と抗体アッセイはSARS-CoV-2感染の診断に使用されていますが、診断のためのウイルス抗原の使用は成功裏に開発されていません。理論的には、ウイルス抗原はウイルスの特異的なマーカーであり、感染集団内での抗体の出現に先行します。迅速かつ早期の診断のために、ウイルス抗原を検出する必要があることは明らかです。
方法
本研究では、7つのセンターからSARS-CoV-2感染が疑われる239名の参加者のコホートを含めました。核酸検査と並行して、鼻咽頭スワブサンプルのヌクレオカプシドタンパク質を測定しました。核酸検査は参照標準として採用され、統計的評価は盲検下で実施されました。別のセンターの20個の尿サンプルでヌクレオカプシドタンパク質を検出し、鼻咽頭スワブ核酸検査を参照標準として使用しました。
結果
鼻咽頭スワブサンプルおよび尿中のSARS-CoV-2のヌクレオカプシドタンパク質を10分以内に検出するための蛍光免疫クロマトグラフィーアッセイを開発しました。ヌクレオカプシドタンパク質陽性および陰性参加者の100％は、同じサンプルの核酸検査に一致しています。さらに、3日間の発熱後の最も早い参加者をこの方法で特定できます。追加の予備研究では、診断されたCOVID-19患者の73.6％で尿中にヌクレオカプシドタンパク質が検出されました。結論これらの発見は、ヌクレオカプシドタンパク質アッセイが、COVID-19の診断のための正確、迅速、早期かつ簡単な方法であることを示しています。尿中のヌクレオカプシドタンパク質の出現は、腎臓に侵入しているSARS-CoV-2の発見と一致し、診断的価値がある可能性があります。
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核酸のカットオフ値を適切に定めると、ヌクレオカプシドタンパク質とかなり相関性が強い。但し偽陰性については調査母体が感染したと思われる集団なので、評価できない。ウイルスの蛋白を直接測定するアッセイ系を作ることに成功している。尿中にかなり出ていると言うことは、尿で検査できるし、尿でコンタミや汚染が起きると言うことだな。便所に近づくとウイルス部分蛋白があるということ、感染まではしないと思うが。
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3／14
Clinical Characteristics of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): An Updated Systematic Review
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.07.20032573v2.full.pdf
medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.07.20032573
目的新規コロナウイルス肺炎（COVID-19）の臨床的特徴は、多くの研究で説明されていますが、結果はさまざまです。科学文献に関する体系的なレビューを実施し、COVID-19の最初の発生からパンデミックまでの臨床特性に関する重要なデータを統合することを目指しました。方法複数のデータベースを介してCOVID-19の臨床的特徴を含む遡及的観察研究を特定するために、体系的な検索を実施しました。 2人のレビューアが適格な出版物を個別に評価しました。 COVID-19の臨床的特徴に関するデータが抽出され、分析されました。結果COVID-19の臨床的特徴を示す72件のレトロスペクティブ研究が含まれました。合計3470人のCOVID-19患者が、公平な方法で最終分析に統合されました。最も一般的な症状は発熱であり（2878 [83.0％]）、患者の63.4％が発症症状として発熱を示した。胸部CTスキャンで肺の異常所見があった2866例のうち、2528 [88.2％]がありました。検査所見では、2387症例の1498 [62.8％]がリンパ球減少症であり、2091症例の1354 [64.8％]がC反応性タンパク質（CRP）のレベルが増加したことが示されました。合計185 [11.5％]の患者が集中治療室（ICU）に入院しましたが、全体の致死率（CFR）は3.7％でした。中国の湖北省以外で入院した患者と比較して、湖北省の患者のICU入院率は有意に高かった（21.9％対2.5％、p <0.001）。また、COVID-19に起因するCFRは、湖北省では湖北省以外の入国者のそれよりも有意に高かった（10.4％対0.6％、p <0.001）。解釈この大規模な患者ベースの系統的レビューは、COVID-19の発生から現在のパンデミックまでのより正確なプロファイリングを示しています。 COVID-19の動的な進化は、将来の研究で特徴付けられる必要があります。
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.07.20032573v2.full.pdf
medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.07.20032573
目的新規コロナウイルス肺炎（COVID-19）の臨床的特徴は、多くの研究で説明されていますが、結果はさまざまです。科学文献に関する体系的なレビューを実施し、COVID-19の最初の発生からパンデミックまでの臨床特性に関する重要なデータを統合することを目指しました。方法複数のデータベースを介してCOVID-19の臨床的特徴を含む遡及的観察研究を特定するために、体系的な検索を実施しました。 2人のレビューアが適格な出版物を個別に評価しました。 COVID-19の臨床的特徴に関するデータが抽出され、分析されました。結果COVID-19の臨床的特徴を示す72件のレトロスペクティブ研究が含まれました。合計3470人のCOVID-19患者が、公平な方法で最終分析に統合されました。最も一般的な症状は発熱であり（2878 [83.0％]）、患者の63.4％が発症症状として発熱を示した。胸部CTスキャンで肺の異常所見があった2866例のうち、2528 [88.2％]がありました。検査所見では、2387症例の1498 [62.8％]がリンパ球減少症であり、2091症例の1354 [64.8％]がC反応性タンパク質（CRP）のレベルが増加したことが示されました。合計185 [11.5％]の患者が集中治療室（ICU）に入院しましたが、全体の致死率（CFR）は3.7％でした。中国の湖北省以外で入院した患者と比較して、湖北省の患者のICU入院率は有意に高かった（21.9％対2.5％、p <0.001）。また、COVID-19に起因するCFRは、湖北省では湖北省以外の入国者のそれよりも有意に高かった（10.4％対0.6％、p <0.001）。解釈この大規模な患者ベースの系統的レビューは、COVID-19の発生から現在のパンデミックまでのより正確なプロファイリングを示しています。 COVID-19の動的な進化は、将来の研究で特徴付けられる必要があります。
3／14
A deterministic epidemic model for the emergence of COVID-19 in China
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.08.20032854v1.full.pdf
medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.08.20032854.
コロナウイルス病（COVID-19）は、2019年12月に中国の湖北省武漢で発生し、中国の保健当局が前例のない予防および管理措置を講じて、新しいコロナウイルス関連肺炎の拡大を抑制しました。 報告された症例の毎日の更新に基づいて数学的モデルを開発し、流行の進化を研究しています。 このモデルでは、95％の信頼水準で、基本的な繁殖数R0 = 2.82±0.11を推定します。有効な繁殖数が1未満になるのは3月19日から3月21日までの時間。4月2日以降に流行が終了し、湖北省を除く中国本土では確認された症例の総数の近似値は 14408±429となります。
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.08.20032854v1.full.pdf
medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.08.20032854.
コロナウイルス病（COVID-19）は、2019年12月に中国の湖北省武漢で発生し、中国の保健当局が前例のない予防および管理措置を講じて、新しいコロナウイルス関連肺炎の拡大を抑制しました。 報告された症例の毎日の更新に基づいて数学的モデルを開発し、流行の進化を研究しています。 このモデルでは、95％の信頼水準で、基本的な繁殖数R0 = 2.82±0.11を推定します。有効な繁殖数が1未満になるのは3月19日から3月21日までの時間。4月2日以降に流行が終了し、湖北省を除く中国本土では確認された症例の総数の近似値は 14408±429となります。
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どんな計算モデルを使用しているのかわかりませんが、エイプリルフールの4／1には中国大陸では終焉しているそうです。中国大陸だけの話ですが。
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Old Drugs for Newly Emerging Viral Disease, COVID-19: Bioinformatic Prospective
新たに出現したウイルス性疾患COVID-19に対する古い薬のバイオインフォマティクスの展望
https://arxiv.org/ftp/arxiv/papers/2003/2003.04524.pdf
COVID-19は世界中で深刻なパンデミックの脅威となる可能性がある。病気がこれまでにワクチンや薬を承認していないことを考えると、そのような状況では、薬の設計やその作用機序に基づいた古い薬の臨床試験の努力は価値があり、信用できる。受容体としてCOVID-19プロテアーゼの新しくリリースされた座標構造を使用した経験豊富なドッキング実験と、リガンドとして抗ウイルス薬および抗生物質薬の中から思慮深く選択された化学物質がこの文脈でリードしている可能性があります。化学構造に基づいて、HIV-1プロテアーゼ阻害剤から9種類の薬剤を選択し、抗気管支炎薬剤から21種類の候補を選択し、それらを異なるモードおよびネイティブのような相互作用条件でブラインドおよびアクティブな部位指定ドッキングに登録しました。候補の結合能力と阻害能は、チプラナビル(アプティバス)>インジナビル(クリキシバン)>アタザナビル>ダルナビル>リトナビル> HIV-1プロテアーゼ阻害剤のアンプレナビル、
および抗気管支炎薬のセフジトレン（メイアクト）>セフィキシム（セフスパン）>エリスロマイシン>クラリスロマイシンであることが示唆されました。薬物のバイオアベイラビリティ、その疎水性とその結合部位の疎水性、および人体での代謝と不活性化の割合は、ウイルス感染に対する全体的な影響の次の決定要因であり、臨床試験で調査すべき最終結果です。
新たに出現したウイルス性疾患COVID-19に対する古い薬のバイオインフォマティクスの展望
https://arxiv.org/ftp/arxiv/papers/2003/2003.04524.pdf
COVID-19は世界中で深刻なパンデミックの脅威となる可能性がある。病気がこれまでにワクチンや薬を承認していないことを考えると、そのような状況では、薬の設計やその作用機序に基づいた古い薬の臨床試験の努力は価値があり、信用できる。受容体としてCOVID-19プロテアーゼの新しくリリースされた座標構造を使用した経験豊富なドッキング実験と、リガンドとして抗ウイルス薬および抗生物質薬の中から思慮深く選択された化学物質がこの文脈でリードしている可能性があります。化学構造に基づいて、HIV-1プロテアーゼ阻害剤から9種類の薬剤を選択し、抗気管支炎薬剤から21種類の候補を選択し、それらを異なるモードおよびネイティブのような相互作用条件でブラインドおよびアクティブな部位指定ドッキングに登録しました。候補の結合能力と阻害能は、チプラナビル(アプティバス)>インジナビル(クリキシバン)>アタザナビル>ダルナビル>リトナビル> HIV-1プロテアーゼ阻害剤のアンプレナビル、
および抗気管支炎薬のセフジトレン（メイアクト）>セフィキシム（セフスパン）>エリスロマイシン>クラリスロマイシンであることが示唆されました。薬物のバイオアベイラビリティ、その疎水性とその結合部位の疎水性、および人体での代謝と不活性化の割合は、ウイルス感染に対する全体的な影響の次の決定要因であり、臨床試験で調査すべき最終結果です。
3／13
Is SARS-CoV-2 originated from laboratory? A rebuttal to the claim of formation via laboratory recombination
Pages 545-547 | Accepted 28 Feb 2020, Published online: 08 Mar 2020
https://www.tandfonline.com/…/pdf/10.…/22221751.2020.1738279 「Institute for Pure and Applied Knowledge」のCEOであるジェームズライオンズワイラー博士（Dr James Lyons-Weiler ）は、2020年2月3日に、進行中のCOVID-19流行の原因である新規コロナウイルス（SARS-CoV-2）最も可能性が高いのは、実験室の組み換えによって構築された[1]と主張した。彼はSARS-CoV-2が他のコロナウイルスとは一致しないスパイク糖タンパク質遺伝子の中央に位置するユニークな挿入配列（1378 bp）を持っているおり、このユニークな配列が、研究室で使用される一般的な発現ベクターであるpShuttle-SN（補足図2）のいくつかの配列に類似していると主張しました。
Pages 545-547 | Accepted 28 Feb 2020, Published online: 08 Mar 2020
https://www.tandfonline.com/…/pdf/10.…/22221751.2020.1738279 「Institute for Pure and Applied Knowledge」のCEOであるジェームズライオンズワイラー博士（Dr James Lyons-Weiler ）は、2020年2月3日に、進行中のCOVID-19流行の原因である新規コロナウイルス（SARS-CoV-2）最も可能性が高いのは、実験室の組み換えによって構築された[1]と主張した。彼はSARS-CoV-2が他のコロナウイルスとは一致しないスパイク糖タンパク質遺伝子の中央に位置するユニークな挿入配列（1378 bp）を持っているおり、このユニークな配列が、研究室で使用される一般的な発現ベクターであるpShuttle-SN（補足図2）のいくつかの配列に類似していると主張しました。
彼の主張を確認するために、私たちは彼の結果を徹底的に分析し、歪んだ分析にいくつかの重大な間違いを見つけました。したがって、我々は、実験室でSARS-CoV-2を形成するための理論を支持する証拠がなかったという反対の結論を引き出しました。まず、このユニークなシーケンスはSARS-CoV-2に固有のものではありません。天然源から発見されたいくつかのコロナウイルスを並べることにより、SARS-CoV-2からのこの「ユニークな」と主張された配列（1378 bp）は他のコロナウイルス（図1）でも高い配列同一性で発見されました。これは、SARS-CoV-2スパイク遺伝子のこの特定の断片が自然に存在するコロナウイルスに広く拡散しており、実験室からではないことを示していました。
3／13
Compounds with therapeutic potential against novel respiratory 2019 coronavirus
DOI: 10.1128/AAC.00399-20 Accepted Manuscript Posted Online 9 March 2020
https://aac.asm.org/…/early/2020/03/03/AAC.00399-20.full.pdf
現在、新規のヒト呼吸器コロナウイルス（SARS-CoV-2、COVID-2019、または2019-nCoVとして知られている）の拡大により、この新しい流行を緩和および阻止するための代替治療法の必要性が強調されています。 2003年の急性呼吸器症候群コロナウイルス（SARS-CoV）や2012年の中東呼吸器症候群コロナウイルス（MERS-CoV）など、以前の高罹患率ヒトコロナウイルスの流行は、潜在的に可能性のある化合物の特性評価を促しました。現在出現中の新規コロナウイルスSARS-CoV-2に対して積極的。最も有望な化合物は、エボラウイルス感染症の治療のために現在臨床試験中のヌクレオチド類似体プロドラッグであるレムデシビル（GS-5734）です。レムデシビルは組織培養におけるSARS-CoVおよびMERS-CoVの複製を阻害し、非ヒト動物モデルで有効性を示しました。さらに、ヒト免疫不全ウイルス1型（HIV-1）プロテアーゼ阻害剤、ロピナビル/リトナビル、およびインターフェロンベータ（LPV / RTV-INFb）の組み合わせは、SARS-CoVに感染した患者に効果的であることが示されました。 LPV / RTV-INFbは、MERS-CoVに感染したマーモセットとマウスの臨床パラメーターも改善しました。驚くべきことに、トランスジェニックヒト化マウスモデルにおいて、レムデシビルの治療効果は、MERS-CoVに対するLPV / RTV-INFbの治療効果よりも優れているようでした。これら3つの新規ヒトコロナウイルス感染症、SARS-CoV、MERS-CoV、およびSARS-CoV-2に関連する比較的高い死亡率は、炎症誘発性応答が病因に役割を果たす可能性があることを示唆しています。生成された炎症状態を標的とすべきかどうかは不明のままです。コロナウイルスのみを標的とする治療薬は、高度に病原性の感染を元に戻すことができない可能性があります。このミニレビューは、SARS-CoV-2感染と戦う可能性を示した治療化合物の要約を提供することを目的としています。
DOI: 10.1128/AAC.00399-20 Accepted Manuscript Posted Online 9 March 2020
https://aac.asm.org/…/early/2020/03/03/AAC.00399-20.full.pdf
現在、新規のヒト呼吸器コロナウイルス（SARS-CoV-2、COVID-2019、または2019-nCoVとして知られている）の拡大により、この新しい流行を緩和および阻止するための代替治療法の必要性が強調されています。 2003年の急性呼吸器症候群コロナウイルス（SARS-CoV）や2012年の中東呼吸器症候群コロナウイルス（MERS-CoV）など、以前の高罹患率ヒトコロナウイルスの流行は、潜在的に可能性のある化合物の特性評価を促しました。現在出現中の新規コロナウイルスSARS-CoV-2に対して積極的。最も有望な化合物は、エボラウイルス感染症の治療のために現在臨床試験中のヌクレオチド類似体プロドラッグであるレムデシビル（GS-5734）です。レムデシビルは組織培養におけるSARS-CoVおよびMERS-CoVの複製を阻害し、非ヒト動物モデルで有効性を示しました。さらに、ヒト免疫不全ウイルス1型（HIV-1）プロテアーゼ阻害剤、ロピナビル/リトナビル、およびインターフェロンベータ（LPV / RTV-INFb）の組み合わせは、SARS-CoVに感染した患者に効果的であることが示されました。 LPV / RTV-INFbは、MERS-CoVに感染したマーモセットとマウスの臨床パラメーターも改善しました。驚くべきことに、トランスジェニックヒト化マウスモデルにおいて、レムデシビルの治療効果は、MERS-CoVに対するLPV / RTV-INFbの治療効果よりも優れているようでした。これら3つの新規ヒトコロナウイルス感染症、SARS-CoV、MERS-CoV、およびSARS-CoV-2に関連する比較的高い死亡率は、炎症誘発性応答が病因に役割を果たす可能性があることを示唆しています。生成された炎症状態を標的とすべきかどうかは不明のままです。コロナウイルスのみを標的とする治療薬は、高度に病原性の感染を元に戻すことができない可能性があります。このミニレビューは、SARS-CoV-2感染と戦う可能性を示した治療化合物の要約を提供することを目的としています。
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A preliminary study on serological assay for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in 238 admitted hospital patients
doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.06.20031856
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.06.20031856v1.full.pdf
SARS-CoV-2の血清学的アッセイの診断的価値を評価することを目的としました。方法2020年2月6日から2020年2月14日までにSARS-CoV-2感染が確認または疑われた入院患者238人の血清をスクリーニングするために、SARS-CoV-2のNタンパク質に対するIgMおよびIgG抗体の新たに開発されたELISAアッセイを使用した。SARS-CoV-2 RNAは、咽頭スワブ検体でリアルタイムRT-PCRにより検出されました。所見238人の患者のうち、194人（81.5％）が抗体（IgMおよび/またはIgG）陽性であることが検出され、ウイルスRNAの陽性率（64.3％）よりも有意に高かった。確認された患者（83.0％、127/153）と、核酸検査が陰性である疑いのある患者（78.8％、67/85）の間で抗体陽性率に差はありませんでした。患者が試験サンプルが収集された日に基づいて疾患のさまざまな段階に定義された後、分析結果は、抗体陽性率が症状の最初の発症後最初の5日間で非常に低く、その後急速に増加することを示しました病気が進行しました。 10日後、抗体陽性率は50％未満から80％以上に跳ね上がりました。それどころか、ウイルスRNAの陽性率は、症状の最初の発症後最初の11日間で60％を超えて維持され、その後急速に減少しました。さらに、6〜10日間症状の疑われる患者の半数が抗体陽性であることが検出されました。解釈疑わしい患者は、SARS-CoV-2に感染した可能性が最も高かった。症状の最初の発症後11日目までに、ウイルス検査はウイルス感染の確認に重要です。血清学的アッセイの組み合わせにより、診断効果が大幅に向上します。その後、ウイルス感染の診断は主に血清学的検査に依存するはずです。
doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.06.20031856
https://www.medrxiv.org/…/10…/2020.03.06.20031856v1.full.pdf
SARS-CoV-2の血清学的アッセイの診断的価値を評価することを目的としました。方法2020年2月6日から2020年2月14日までにSARS-CoV-2感染が確認または疑われた入院患者238人の血清をスクリーニングするために、SARS-CoV-2のNタンパク質に対するIgMおよびIgG抗体の新たに開発されたELISAアッセイを使用した。SARS-CoV-2 RNAは、咽頭スワブ検体でリアルタイムRT-PCRにより検出されました。所見238人の患者のうち、194人（81.5％）が抗体（IgMおよび/またはIgG）陽性であることが検出され、ウイルスRNAの陽性率（64.3％）よりも有意に高かった。確認された患者（83.0％、127/153）と、核酸検査が陰性である疑いのある患者（78.8％、67/85）の間で抗体陽性率に差はありませんでした。患者が試験サンプルが収集された日に基づいて疾患のさまざまな段階に定義された後、分析結果は、抗体陽性率が症状の最初の発症後最初の5日間で非常に低く、その後急速に増加することを示しました病気が進行しました。 10日後、抗体陽性率は50％未満から80％以上に跳ね上がりました。それどころか、ウイルスRNAの陽性率は、症状の最初の発症後最初の11日間で60％を超えて維持され、その後急速に減少しました。さらに、6〜10日間症状の疑われる患者の半数が抗体陽性であることが検出されました。解釈疑わしい患者は、SARS-CoV-2に感染した可能性が最も高かった。症状の最初の発症後11日目までに、ウイルス検査はウイルス感染の確認に重要です。血清学的アッセイの組み合わせにより、診断効果が大幅に向上します。その後、ウイルス感染の診断は主に血清学的検査に依存するはずです。
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試されている文明（私見）
COVID-19によって、思想や信仰や政治体制、金融システム、そして科学技術を含めた社会全体、文明が試されているかに思える。パンデミックは今回の感染爆発以前にもあった。
人類は石器や火や農耕や火薬や信仰や金融や政治体制や核兵器、分子生物学、プログラミングなどいくつもの種類の脅威を経験し、今なお進行中である。
COVID-19によって、思想や信仰や政治体制、金融システム、そして科学技術を含めた社会全体、文明が試されているかに思える。パンデミックは今回の感染爆発以前にもあった。
人類は石器や火や農耕や火薬や信仰や金融や政治体制や核兵器、分子生物学、プログラミングなどいくつもの種類の脅威を経験し、今なお進行中である。
今回の感染爆発において、社会の安寧を維持しつつ、解決方向を集団的に競争や試行錯誤を含めた協議によって探っていく必要がある。人ごとのように言ってるわけではない。国の風習から診療システム、医療技術、更に政治経済外交がためされ、大げさに言うと文明が試されている。
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