2020年3月4日水曜日

corona関連4

03/01
○「新型コロナウイルス感染症 ~市民向け感染予防ハンドブック」賀来 満夫先生は長崎大学医学部のサッカー部の先輩で、とても優しい先輩でした。http://tmpuh.net/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B3%E3%83%AD%E3%83…  ハンドブックは、2月25日時点の情報に基づき作成


03/01
Report of the WHO-China Joint Mission
on Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Report
16-24 February 2020
https://www.who.int/…/who-china-joint-mission-on-covid-19-f…
Children
Data on individuals aged 18 years old and under suggest that there is a relatively low attack rate in this age group (2.4% of all reported cases). Within Wuhan, among testing of ILI samples, no children were positive in November and December o
f 2019 and in the first two weeks of January 2020. From available data, and in the absence of results from serologic studies, it is not possible to determine the extent of infection among children, what role children play in transmission, whether children are less susceptible or if they present differently clinically (i.e. generally milder presentations). The Joint Mission learned that infected children have largely been identified through contact tracing in households of adults. Of note, people interviewed by the Joint Mission Team could not recall episodes in which transmission occurred from a child to an adult.

18歳以下の個人に関するデータは、この年齢層の攻撃率が比較的低いことを示唆しています(報告されたすべての症例の2.4%)。 武漢では、ILIサンプルの検査の中で、2019年の11月と12月および2020年1月の最初の2週間に陽性の子供はいませんでした。 入手可能なデータから、また血清学的研究の結果がない場合、子どもの感染の程度、子どもが伝染で果たす役割、子どもの感受性が低いかどうか、または臨床的に異なって現れるかどうか(すなわち、一般に軽度の症状)を判断することはできません )。 合同ミッションは、感染した子供が大人の世帯での接触追跡を通じて主に特定されていることを学びました。 注目すべきは、共同ミッションチームがインタビューした人々は、子供から大人に感染が起こったエピソードを思い出せなかったということです。
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Team could not recall episodes という言及の根拠を知りたい

03/02
WHO Director-General's opening remarks at the media briefing on COVID-19 - 28 February 2020
こっちはわかりやすい。
過去24時間で、中国は329症例を報告しました。これは1か月以上で最低です。ジュネーブ時間の午前6時現在、中国は2791人の死亡を含むCOVID-19の合計78,959件をWHOに報告しています。中国以外では、49か国で4351件、67人が死亡しています。
昨日以来、デンマーク、エストニア、リトアニア、オランダ、ナイジェリアのすべてが最初の症例を報告しています。これらすべてのケースにはイタリアへのリンクがあります。イタリアから14か国に24ケースが輸出され、イランから11か国に97ケースが輸出されました。
過去数日間にわたる症例数の継続的な増加、および影響を受ける国の数は、明らかに懸念事項です。私たちの疫学者はこれらの進展を継続的に監視しており、現在、COVID-19の広がりのリスクと影響のリスクの評価を世界レベルで非常に高くしています。
現時点で私たちが目にしているのは、いくつかの国でCOVID-19の流行にリンクされていますが、ほとんどの症例は既知の接触者または症例の集団にまで遡ることができます。ウイルスがコミュニティで自由に広がっているという証拠はまだありません。それが事実である限り、症例を早期に検出し、患者を隔離してケアし、接触を追跡するための堅牢な措置が取られた場合、このウイルスを封じ込める可能性があります。
昨日言ったように、国によってシナリオは異なりますし、同じ国の中で異なるシナリオがあります。このウイルスを封じ込める鍵は、感染の連鎖を断つことです。昨日、私は、各国が症例に備え、今後の感染を防ぐためにしなければならないことについて話しました。
WHO-中国共同ミッションの報告書は現在、その報告書を公開しており、これはWHOのウェブサイトで英語で利用可能であり、また国家保健委員会のウェブサイトでも中国語で掲載されます。このレポートには、中国、影響を受ける国と影響を受けない国、国際社会、および一般市民向けの豊富な情報と22の推奨事項が含まれています。
これは、すべての国が人口を教育し、サーベイランスを拡大し、すべての症例を見つけ、隔離し、世話をし、すべての接触を追跡し、政府全体および社会全体のアプローチをとることを求めています。厚生省だけの仕事。
同時に、ワクチンと治療薬の研究も進んでいます。20以上のワクチンが世界的に開発されており、いくつかの治療薬が臨床試験中です。数週間のうちに最初の結果を期待しています。しかし、ワクチンや治療薬を待つ必要はありません。今日、すべての個人が自分自身や他の人を守るためにできることがあります。
あなたのリスクは、あなたが住んでいる場所、あなたの年齢、一般的な健康状態に依存します。WHOは一般的なガイダンスを提供できます。また、各国のガイダンスに従い、地元の医療専門家に相談してください。
ただし、知っておくべき10の基本事項があります。
まず、私たちが言い続けているように、アルコールベースの手で定期的に手をこするか、石鹸と水で手を洗ってください。汚染された表面や病気の人に触れた後に顔に触れることは、ウイルスが伝染する可能性のある方法の1つです。手をきれいにすることで、リスクを減らすことができます。
第二に、キッチンベンチや作業机など、消毒剤で定期的に表面をきれいにします。
第三に、COVID-19について教育します。情報が信頼できるソース(地元または国の公衆衛生機関、WHO Webサイト、または地元の医療専門家)からのものであることを確認してください。誰もが症状を知っている必要があります-ほとんどの人にとって、鼻水ではなく発熱と乾いた咳から始まります。ほとんどの人は軽度の病気にかかり、特別なケアを必要とせずに良くなります。
第4に、発熱や咳がある場合は旅行を避け、フライト中に病気になった場合はすぐに乗組員に知らせてください。帰宅したら、医療専門家と連絡を取り、どこに行ったかを伝えてください。
第5に、咳やくしゃみをする場合は、袖に入れるか、ティッシュを使用します。すぐにティッシュを閉じたゴミ箱に捨ててから、手をきれいにしてください。
第六に、60歳以上の場合、または心血管疾患、呼吸器疾患、糖尿病などの基礎疾患がある場合、重度の疾患を発症するリスクが高くなります。混雑したエリア、または病気の人とやり取りする可能性のある場所を避けるために、特別な予防策を講じることができます。
第七に、すべての人にとって、気分が悪いときは家にいて医師または地元の医療専門家に電話してください。彼または彼女はあなたの症状、あなたがどこにいたか、あなたが誰と接触したかについていくつか質問をします。これにより、適切なアドバイスが得られ、適切な医療施設に送られ、他の人への感染を防ぐことができます。
第8に、病気の場合は、家にいて、家族とは別に食事と睡眠をとり、別の道具やカトラリーを使用して食事をします。
9番目に、息切れが発生した場合は、医師に連絡してすぐに治療を受けてください。
そして第10に、特にあなたが影響を受けた国やコミュニティに住んでいる場合、不安を感じることは普通で理解できることです。コミュニティで何ができるかを調べてください。職場、学校、礼拝所で安全を保つ方法について話し合ってください。
一緒に、私たちは強力です。封じ込めはあなたから始まります。
現時点での最大の敵はウイルスそのものではありません。それは恐怖、噂、スティグマです。そして、私たちの最大の資産は、事実、理由、連帯です。
03/02

03/03
03/03
ウイルス粒子と、RNA strandと、蛋白(ウイルス増殖の為に寄生した細胞内でウイルスが産生させたモノ)の三者に乖離があり、これが感染性とPCR検査の乖離につながっている?アルコールなどによってウイルス粒子表面を壊しても、残ったRNA strandは感染性を再度獲得するかもしれない?提案的な論文でプレプリントです。以下紹介
Can the novel coronavirus transmit via RNAs without 1 protein capsids?
Short title: Novel coronavirus transmit via RNAs
Zhongneng Xu*1, 2, Shuichi Asakawa*2
Last edited: Feb 28, 2020 UTC
新規コロナウイルスは、1つのタンパク質カプシドなしでRNAを介して伝播できますか?
短いタイトル:RNAを介した新規コロナウイルスの伝達
中年徐* 1、2、浅川修一* 2
Zhongneng Xu、txuzn @ jnu.edu.cn、axuzhongneng @ mail.ecc.u-tokyo.ac.jp; 浅川修一、asakawa @ mail.ecc.u7 tokyo.ac.jp
済南大学生態学部、広州510632、中国; 2 東京大学大学院農学生命科学研究科水生生物科学部門、東京113-8657、日本
概要
新規コロナウイルス(SARS CoV 2)のいくつかの感染イベントのメカニズムは不明であり、伝送モードの新しいアイデアが奨励されます。本論文では、SARS-CoV-2 RNA の感染性が紹介されました。RNA感染の可能な説明には、SARS-CoV-2の複製およびその他の代謝プロセスを制御するRNA鎖、人から人へ伝染するのに十分なRNAの推定安定化時間、遊離RNAによって伝染する別の感染症の報告などが含まれますしたがって、さらなる研究が提案されました。環境におけるSARS-CoV-2 RNAとタンパク質の比率とSARS-CoV-2粒子におけるその比率との比較を行って、遊離RNAの存在を証明することができた環境内のウイルスのゲノム。ウイルス感染のリスクを評価し、RNA伝達の方向と起源を分析するには、空間内のRNA の濃度分布を検出する空間アレイ法を適用する必要があります。ウイルスRNA鎖とタンパク質の量が異なる患者の状態は、無症候性感染の現象を説明するための候補の理由の1つでした。SARS-CoV-2 RNAの感染性に基づいた、より厳しい保護対策が提供されました。この観点を証明する必要がありますが、いくつかの言及された研究提案と病気の広がりに対する保護対策は、他のウイルス性疾患やSARS-CoV-2の非RNA感染の状態に役立ちます。
キーワード= SARS-CoV-2、伝播、RNA、空間分布、無症候性感染
 致命的な新規コロナウイルスである重度の急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)の大量のヒトからヒトへの感染が確認されています[1-3]。感染は猛烈で、専門的な保護意識と優れた保護具を備えた多くの医療関係者でさえ感染しています。伝送の詳細の一部は不思議です。研究者らは、直接接触および液滴による伝播に加えて、糞便や涙などの患者の一部のアイテムでSARS-CoV-2核酸も発見しました[4-5]。さらに、この疾患の無症候性感染が報告されています[6]。多くの国では、最高レベルの感染症防御システムを有効にしていますが、SARS-CoV-2がコミュニティに広がるのを防ぐことはできません。既存の知識では感染イベントの現象の一部を説明できないことを示している可能性があり、伝送モードに関連する新しいアイデアが推奨されます。RNA鎖はSARS-CoV-2の唯一の遺伝物質であるため、タンパク質キャプシドなしで、あるホストから別のホストに移動し、転写と複製の活動を維持することができます。RNAの感染性は、SARS-CoV-2の感染経路の1つと見なすことができます。ここで、考えられる理由、さらなる研究提案、予防策を示しました。可能なメカニズム
RNAは、新規コロナウイルスの最も重要な材料です。宿主細胞に対するSARS53 CoV-2攻撃中、正のRNA鎖のみが細胞に入り、最終的に発現、遺伝物質の複製、ウイルス全体のアセンブリなどを通じて細胞を破壊します[7]。カプシド粒子はRNA鎖を保護し、宿主細胞膜受容体に結合して細胞を潜らせることができますが、RNAのないカプシド粒子には複製能力がありません。ただし、タンパク質シェルのない遊離RNA鎖が宿主細胞に入ることができる限り、SARS-CoV-2 粒子と同様に生物学的プロセスを完了することができます。コロナウイルスでは、正のRNA鎖をテンプレートとして使用して負のRNA鎖を生成し、負の鎖をテンプレートとして使用して正の鎖を複製します。プラス鎖とマイナス鎖の両方がmRNAを転写できます。mRNAからの遺伝情報で翻訳されたタンパク質は、正のRNA 鎖を被覆してウイルス粒子を形成します。したがって、コロナウイルス粒子を伴う正および負のRNA鎖は、感染者から放出されます。さらに、外のコロナウイルス粒子のタンパク質カプシド65 が破壊されると、RNAも環境にさらされます。
 SARS-CoV-2の遊離RNA鎖は、空中に浮遊する可能性があります。ウイルス粒子に比べ、新規コロナウイルスRNAは、空気中で容易にフロートです。新規コロナウイルスRNAゲノムは、いくつかのRNA配列と同様である30キロバイト[8]である他の生物の。新規コロナウイルスRNAゲノムの分子量は1×104 KDで、コロナウイルス粒子の分子量の約500分の1です。このサイズにより、SARS-CoV-2 RNAは沈降しにくくなり、安定性が許せばより長い距離にドリフトする可能性があります。大気環境における新規コロナウイルスRNA配列の安定性は大きな問題です。細胞内のRNAの寿命は通常数分から数日であり[9]、宿主細胞内のウイルスRNAは特定のタンパク質への結合などの何らかの手段による分解プロセスを回避します[10]。一部のRNA実験では、RNA は空気中で数分以上安定する場合があります。RNAを抽出するプロセスを例にとると、乾燥RNAは室温で10 分間、空気中で安定します。コロナウイルスのRNA鎖が空中でどれくらい長く生存できるかは不明ですが、場合によっては、新しいホストを見つけるのに数秒で十分な場合もあります。
 SARS-CoV-2 RNAが宿主細胞と接触する場合、細胞内にどのように侵入するかが重要な問題です。細胞は、エンドサイトーシスを介して、小さなウイルスやナノ粒子などの小さな粒子を細胞に飲み込むことができると報告されています[11-12]。したがって、新しい宿主の気道および消化管の表皮細胞は、エンドサイトーシスなどのプロセスを介してコロナウイルスRNAを細胞に飲み込む可能性があります。新規コロナウイルスRNAは、損傷部位から細胞に侵入したり、損傷した細胞の成分を使用してウイルス粒子を合成したりすることもできます。遊離RNAを介したいくつかの感染性病原体の伝播が報告されています。高等植物で病気を引き起こすウイロイドは、RNAを介して宿主細胞に感染する可能性があります[13]。これらの病原体は、タンパク質をコーティングせずにRNAのみです。新規コロナウイルスのRNAのように、ウイロイドは宿主細胞内で複製します。ウイロイドは小さな穴から植物細胞に侵入し[14]、SARS-CoV-2 RNAの侵入を可能にするヒト細胞内のチャネルを見つけることは、植物細胞内で見つけるよりも難しくないかもしれません。さらなる研究提案
 利用可能な新規コロナウイルスRNAのレベルと、環境中の遊離SARS-CoV-2 RNAの存在をどのように判断するかは、RNA伝達において重要な役割を果たします。生産および分解されたRNA鎖の量分析は、最初のステップです。細胞内の陽性RNAと陰性RNAの両方の量は変動すると考えられています[15]。細胞内で産生される新規コロナウイルスRNA 鎖には、いくつかの宛先があります。
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生成された総RNA鎖  =セル内のプラス鎖+セル内のマイナス鎖 + セル外のプラス鎖+ セル外のマイナス鎖  + セル内のコロナウイルス粒子内のプラス鎖  +コロナウイルス粒子内のマイナス鎖細胞  + 細胞外のコロナウイルス粒子内のプラス鎖  + 細胞外のコロナウイルス粒子内のマイナス鎖+分解されたプラス鎖+分解されたマイナス鎖
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 ウイルス粒子の内側と外側のRNA鎖は、分解されたものを除き、患者から放出されます。反逆者として、免疫細胞と抗体を使用してウイルスタンパク質と核酸を直接殺すことに加えて、宿主細胞は新規コロナウイルスRNA鎖の正常な複製を妨害する可能性もあります。したがって、放出可能なRNA 鎖の量は、複雑な要因の影響を受けます。環境中の遊離コロナウイルスRNAの存在をどのように判断するかは、本研究のアイデアを部分的に証明するための重要な質問です。環境内の新規コロナウイルスの核酸試験の陽性結果は、環境内に新規コロナウイルス粒子が存在することを証明するものではなく、コロナウイルスRNAの存在のみを示しています。場合さらに検出結果は、環境中のRNAの割合が高いことを示す、新規なコロナウイルス粒子中のRNAの割合よりも、それが示すかもしれない環境におけるSARS-CoVの-2の遊離のRNAゲノムの存在。
 感染性SARS-CoV-2 RNA鎖の時間的および空間的分布は、必要な研究内容です。一時的な問題の1つの側面は、RNA鎖の寿命です。宿主細胞と空気中の新規コロナウイルスRNA鎖の運命には大きな違いがあり、後者は未知のままです。時間的問題の別の側面は、RNA鎖の感染活動125です。負の相関関係、放物線の関係、時間の経過に伴う安定した感染活動など、感染活動とRNAの年齢との関係は複雑になる場合があります。外部環境の「死んだ」コロナウイルス粒子内のRNA鎖が破壊されない場合、RNA鎖の放出により事態はより複雑になります。分子量の大きな違いのため、空気中のRNA 鎖とウイルス粒子は、両方が同じダストまたは液滴に付着していない限り、異なる流体力学的軌道を持ちます。一般に、RNA 鎖の空間分布はより広くなります。RNA鎖とウイルス粒子の空間分布範囲がわかっている場合、SARS-CoV-2キャリアからの安全距離を推定できます。新規コロナウイルスRNAの空間分布を検出する方法を開発する必要があります。空間アレイ法と空気のろ過による測定を試すことができることをお勧めします。
 空間アレイ法を介して特定の空間で新規コロナウイルスRNAの空間分布を検出するには、一連の手順は次のとおりです:空間内の検出部位を設定→ ゲル、テストストリップ、溶液などのサンプリングメディアを追加RNA 保存液を各検出サイトに配置→ 要件に応じてサンプリングメディアの温度を制御→一定時間後、サンプルを収集してRNAレベルを検出→空間内のRNAの濃度分布を分析→ 方向と起源を分析RNA伝達の。空気ろ過法は、一定量の空気をろ過し、フィルター残留物中の新規コロナウイルスRNAレベルを決定することです。空気ろ過法の前提は、RNA分子をろ過できるろ過装置を見つけることです。空間配列法は詳細な固定小数点定量分析であり、空気ろ過法は比較的粗い定量分析です。
 無症候性感染のメカニズムを研究することは価値があります。感染と症状に関連する新規コロナウイルスの材料には、主にウイルス粒子、正のRNA鎖、負のRNA鎖、ウイルスタンパク質が含まれます。仮定RNA含有要素(ウイルス粒子、ポジティブRNA鎖、および負のRNAことストランド)は、感染性因子およびタンパク質含有要素(ウイルス粒子およびあるウイルスタンパク質)の症状を引き起こす要因です。感染者にとって、これらの要因の組み合わせのパターンは、その人が症状を持っているかどうかを決定します。たとえば、主に155の宿主細胞でRNA鎖の複製がある可能性があるため、キャリアは無症候性ですが、新規コロナウイルスRNA鎖を伝達できます。症状のパターン、ウイルスタンパク質およびウイルス粒子は大きいで産生される症候および感染患者で得られた、数字。数時間から数週間までの宿主における新規コロナウイルスの不規則な潜伏時間は、感染因子と症候因子の組み合わせのパターンに関する上記の仮定によっても説明されるかもしれません。さらに、新しいホストにさらされるウイルス粒子、正のRNA鎖、および負のRNA鎖の割合も、潜在時間に影響を与える可能性があります。
 一般に、新規コロナウイルス粒子は攻撃的なタンパク質を持っているため、RNAを宿主細胞に迅速に注入でき、ウイルス粒子は複製されて患者に症状を示すように誘導します。プラスのRNA鎖は、ウイルス合成プロセスを完了するのと似ていますが、細胞内にすぐには入らないはずです。マイナスRNA鎖の問題は、宿主細胞に入る方法だけでなく、複製する方法でもあり、転写や翻訳、複製を正しい順序で行うために長い時間や他の要因を待つ場合があります。したがって、宿主細胞の負のRNA鎖のみが、長い潜伏期間を引き起こす候補の1つです。
 RNA感染に関連する他の問題にも注意を払う必要があります。RNAやDNAを使用して人から人へ感染する他のウイルスが存在する場合があります。一般的な環境では、DNAはRNAでより安定であり、その後の可能性DNAウイルスおよびレトロウイルスからの感染性DNA鎖は価値研究です。このように、温度、湿度、空気の圧力などの環境要因の影響の安定性のようなウイルス核酸及び他の質問の送信処理水中のウイルスRNAは、考慮する必要があります。
予防策の提案
 上記は仮定にすぎませんが、これらが間違っていることが証明される前に、既存の防御手段を改善して病気のspread延を防ぐ必要があります。
 SARS-CoV-2の核酸検査は、正のRNA 鎖だけでなく、負のRNA鎖も標的にする必要があります。負のRNA鎖は新規コロナウイルス粒子には含まれていませんが、負の鎖は人が感染していることを確認でき、本研究で説明されているように伝染する可能性があります。185 核酸フィンガープリントと負のRNA鎖の完全な配列の検出は、環境での感染リスクの評価に役立ち、核酸検査での偽陰性結果を大幅に削減します。
 タンパク質を不活性化する消毒方法は、新規コロナウイルスRNAを破壊しない可能性があります。ウイルスタンパク質は侵襲的であり、新規コロナウイルスはその攻撃性を高めるエンベロープを持っています。薬用アルコールなどの一部の消毒剤によるウイルスおよびエンベロープのタンパク質タンパク質の変性は、常にウイルスを殺すと見なされます。ウイルスタンパク質とエンベロープのみを不活性化すると、実際に攻撃性が低下しますが、損傷したタンパク質を含む新規コロナウイルスは、RNA鎖が新規コロナウイルスの複製と代謝を制御するために必要な要素であるため、潜在的な生物学的活性と感染性がまだあります。したがって、新規コロナウイルスのRNA鎖を損傷する可能性のある消毒方法を使用することをお勧めします。
 感染者がSARS-CoV-2を送信できる空間的および時間的範囲は、以前に推定されたものよりはるかに大きい場合があります。新規コロナウイルスのキャリアからの感染の半径は数メートル以上であり、RNA鎖の寿命が許せば、感染の半径は時間とともに拡大し続けます。新規のコロナウイルス粒子と比較して、このウイルスの感染性RNA鎖は、より遠くに浮遊する可能性があるため、伝播のリスクが高く、群衆が集まると事態は悪化します。したがって、上記の空間アレイ法と空気ろ過法、または他の代替方法を使用して、混雑した場所での新規コロナウイルスRNAの空間分布を定期的に決定し、ウイルス感染のリスクを評価することをお勧めします。
 マスクなどの現在の抗感染デバイスは、RNA分子からの感染を防ぐことができない場合があります。マスクとフィルタリングガスマスクは、ほこりや水滴に付着した新規コロナウイルス粒子とRNA鎖のほとんどを除去できますが、空気中に浮遊する遊離RNAをフィルタリングすることは困難です。適切な解決策がない場合は、感染患者やウイルスキャリアと直接接触する必要がある人々に隔離された防毒マスクを適用する必要があります。
結論
 SARA-CoV-2がRNA鎖を使用して拡散するという考えは、ウイルス性疾患の感染メカニズムの研究に役立ち、実験的および臨床的検証が急務です。この観点に基づいて、より厳格な保護対策を開発する必要があります。これは、健康な人々を保護するのに意味があります。遊離ウイルスRNA が感染活動を維持するかどうかは興味深いものであり、生命の起源の問題に関連しています。RNAの場合、環境で生産される最初の遺伝物質が議論されます。私たちは、ウイルスRNAの感染については、この問題に関する更なる検討が多くの有用な情報につながると信じている。



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