2020年3月10日火曜日

corona関連6

3/10
Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study
The Lancet Published: March 9, 2020
https://www.thelancet.com/…/Lancet/pdfs/S014067362305663.pdf
背景:コロナウイルス感染症2019(COVID-19)は、2020年12月に中国で初めてヒトで発生し、その後世界中に広がった新興感染症です。この研究の目的は、COVID-19の結果を予測するために、臨床および実験室の指標を記述および評価することでした。
方法:中国武漢のジンインタン病院に入院したCOVID-19が確認された連続患者は、2020年12月26日から1月31日まで含まれました。すべての患者は、2月10日までに明確な臨床転帰(退院または死亡)を示しました。被験者のAUC)を使用して、実験室パラメーターの予測効率を評価しました。独立した予後因子を評価するために、多重ロジスティック回帰が使用されました。
所見:この研究には、COVID-19が確認された127人の入院患者が含まれ、91人が治癒し、36人が死亡した。 COVID-19死亡の最も一般的な合併症は、急性心損傷(21人の患者、58.3%)、ARDS(20人の患者、55.6%)、凝固機能障害(14人の患者、38.9%)、および急性腎障害(12人の患者、33.3%) )。死亡した患者は、多臓器不全症候群を有する可能性が高かった(p <0.001)。死亡した患者は、入院時の肝機能および腎機能の悪化、組織損傷に関連するバイオマーカー(乳酸デヒドロゲナーゼ、クレアチンキナーゼおよびトロポニンI)の悪化、プロトロンビン時間の延長をもたらしました。 c反応性タンパク質、フェリチン、プロカルシトニン、インターロイキン6(IL-6)レベルを含む炎症性バイオマーカーも大幅に増加しました。レシーバー動作特性曲線(AUC)の下の領域は、入院時のCD3陽性、CD4陽性、およびCD8陽性のリンパ球数が臨床転帰に対して良好な予後値を示した(それぞれAUC = 0.915、0.886および0.870)リンパ球数血液ルーチン検査では中等度でした(AUC = 0.732)。さらに、乳酸脱水素酵素、トロポニンI、プロトロンビン時間、およびプロカルシトニンの予後値はそれぞれ良好でした(それぞれ、AUC = 0.928、= 0.939、= 0.920、= 0.900。重回帰モデルにより、CD3 +リンパ球カウント≤470/ µl、プロトロンビンtime≥13.5sおよびprocalcitonin≥0.15ng / mlは、死亡の独立した予後因子でした。
解釈:COVID-19の臨床結果に対するCD3 +リンパ球タイピングカウントの予測効果は、通常のリンパ球カウントよりも優れていました。入院時のプロカルシトニンおよびプロトロンビン時間の上昇は、死の独立した予後因子でした。

3/10
COVID-19患者が手術を必要とする場合に私たちが行うこと:手術室の準備とガイダンス
What we do when a COVID-19 patient needs an operation: operating room preparation and guidance
Canadian Journal of Anesthesia (2020)Cite this article Published: 06 March 2020













3/10
妊娠中の新規コロナウイルス病(COVID-19):どのような臨床的推奨事項に従うべきですか?
あんまり重要なことは書いてないが、標準的な内容
Novel corona virus disease (COVID‐19) in pregnancy: What clinical recommendations to follow?
Acta Obstetricia et Gynecologica Scandinavica
First published: 05 March 2020 https://doi.org/10.1111/aogs.13836


3/10
COVID-19感染の小児患者における臨床およびCTの特徴:成人とは異なる点
Clinical and CT features in pediatric patients with COVID‐19infection: Different points from adults
Pediatric Pulmonology https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/ppul.24718
Received: 14 February 2020|Accepted: 26 February 2020DOI: 10.1002/ppul.24718
小児患者の臨床症状は、発熱や咳などの成人の症状と似ています。数人の子供には下痢と鼻水がありますが、全体的な症状は比較的軽度です。 3人の新生児を含む13人の小児患者は、COVID-19 RNA検出を受けたCOVID-19と診断された家族と密接な接触のある特定の病歴がありました。 3人の新生児の結果は陽性でしたが、胸部CTで病変は見つかりませんでした。汚染されたサンプルの可能性やその他の理由を排除するために、繰り返しCOVID-19 RNA検出を実行する必要があります。以前の研究では垂直伝播の証拠が確認されていないため、8つの密接な接触が本研究の肯定的な結果の可能な説明である可能性があります。注目すべきことに、20人中7人の患者は先天性疾患または後天性疾患の既往歴があり、これは、基礎疾患を有する小児がCOVID-19感染の影響を受けやすいことを示している可能性があります。全体として、小児患者の予後は一般的に良好であり、平均入院期間は12。9日です。
PCTはバクテリオトキシンによって誘発される可能性があるがインターフェロンによって抑制される細菌感染のマーカーです9。この研究では、PCTが80%のケースで上昇したことは注目に値します。患者。小児患者では、共感染が一般的であったため(40%)、定期的な抗菌薬治療を検討する必要があることが示唆される場合があります。
小児患者のほとんどは軽度の症例であるため、単純な胸部X線では病変または詳細な特徴が示されないことが多く、誤診や診断ミスにつながります。したがって、早期胸部CT検査が非常に必要です。 COVID-19ウイルスの陰性核酸を持つ小児患者の一部では、胸部CTに示される典型的な病変に従って疑わしい患者として管理しました。これは、小児の早期治療だけでなく、感染源を効果的に隔離する証拠も提供できます感染の。
小児の胸部CT所見は成人のものと類似しており、そのほとんどは軽度の症例でした。周囲のハローサインとの統合が最大50%のケースを占めているため、小児患者の典型的なサインと見なす必要があります。胸水は見られなかった。胸部CTの病変の吸収は、臨床症状と核酸検出に遅れをとっていました。 2回の連続した核酸検査が陰性の場合、胸部CTで病変がまだ見える可能性があります。核酸検査が陽性の3人の新生児での正常な所見については、それがサンプリングに対する送達プロセスの影響によるものか、新生児の特定のCT症状によるものであるかにかかわらず、さらなる確認のためにより多くのサンプルが必要です。
COVID-19感染のCTイメージングは​​、インフルエンザウイルス、パラインフルエンザウイルス、RSウイルス、アデノウイルスなどの他のウイルス性肺炎と区別する必要があります。RSウイルスおよびパラインフルエンザウイルス肺炎の病変は、気管支壁が厚くなった気管支樹に沿ってほとんど分布していた。インフルエンザウイルスは、肺にグリッド状の変化を引き起こす可能性があります。さらに、細菌性肺炎、マイコプラズマ肺炎、クラミジア肺炎と区別する必要があり、後者の病原体によって引き起こされる肺炎病変の密度は比較的高くなります。ただし、異なる病原体によって引き起こされる肺炎の胸部CT症状は重複し、COVID-19肺炎は他の種類の病原体によって引き起こされる肺炎と重なる可能性があり、より深刻で複雑な画像症状を呈するため、疫学的および病因学的検査を組み合わせる必要があります。
結論として、小児のCOVID-19ウイルス肺炎は主に軽度であり、胸部CTは胸膜下のすりガラス陰影の特徴的な変化と周囲のハローとの統合を示す可能性があり、これは肺病変の追跡と評価のための効果的な手段です。咽頭スワブサンプルからのCOVID-19核酸検査の陽性率が高くない場合、CTによる病変の早期発見は、小児患者の合理的な管理と早期治療に役立ちます。しかし、特に他の病原体との同時感染の場合、CTイメージングだけでCOVID-19肺炎を診断するだけでは十分ではありません。したがって、早期胸部CTスクリーニングとタイムリーなフォローアップは、対応する病原体検出と組み合わせて、子供たちにとって実行可能な臨床プロトコルです。

3/08
https://www.nature.com/articles/d41586-020-00154-w
NEWS 05 MARCH 2020
Coronavirus latest: children are as susceptible as adults, study suggests
3月5日15時30分GMT —中国の調査によると、子供は大人と同じように感染する可能性が高い
子供たちは大人と同じように新しいコロナウイルスに感染する可能性があり、SARS-CoV-2として知られているウイルスの広がりに関してこれまでに発表された最も詳細な研究の1つを見つけました。この分析は、中国の深センのデータに基づいており、アウトブレイクを取り巻く最も差し迫った質問の1つである子供の役割に対する部分的な回答を提供します。
過去の研究では、コロナウイルスに感染した場合、他の年齢層と比較して、子供が重度の症状を発症する可能性がはるかに低いことが示唆されています。しかし、彼らが感染していないためか、他の人よりも効果的に感染と戦っているのかは明らかではありませんでした。
「子供は感染する可能性が高く、病気になりません」と、メリーランド州ボルチモアのジョンズ・ホプキンス・ブルームバーグ公衆衛生学校の感染症疫学者ジャスティン・レッサーは言います。彼は、深sのハルビン工科大学のジョンズ・ホプキンス疫学者キファン・ビ、および疫学者のティン・マ、深Shenzhen疾病管理予防センターのティエジアン・フェンと共同研究を主導しました。彼らは分析を3月4日にmedRxivプレプリントサーバーに投稿しました。
この研究は、ウイルスに感染した人だけでなく、多くの密接な接触者も見たという点でユニークです。研究者は、症状に基づいて診断された391人、および1,286人の密接な接触者を追跡し、症状を示さなかったとしてもウイルスが陽性であるかどうかを確認しました。全体として、このチームは、ウイルスに感染する可能性のある10歳未満の子供が他の年齢層と同様に感染する可能性が高く、既知の症例の接触者の約7〜8%が後に検査で陽性であることを発見しました。
彼らはまた、ウイルスに感染した人と同じ家庭に住んでいて、彼らと密接に接触した人は、他の環境で感染した人と接触した人と比較して、感染する可能性が約6倍高いことも発見しました。
「これは、子供が大人と同じくらいSARS-CoV-2感染にかかりやすいという最初の明確な証拠かもしれません」と、香港大学の感染症疫学者であるベン・カウリングは言います。彼は今、学校でアウトブレイクが観察されていないという事実は、子供の症状が軽度であるという事実にまで及んでいるのではないかと考えています。
レスラーは、子供が日常的に症状を発症し、伝染経路の共通のハブであるインフルエンザのように、子供がウイルスの伝染に重要であるかどうかはまだ明らかではないと言います。 「それは現在残っている重要な質問の1つであり、私たちは答え方を見つけようとしています」と彼は言います。 「私には7ヶ月と6歳がいますが、ウイルスをまったく持っていても、誰かに感染していないとは想像できません。」
この研究は、学校の閉鎖などの措置を通じてウイルスの拡散を遅らせるために重要な意味を持つ可能性があります。 「封じ込めは選択肢ではないと言ったら、子供たちを無視することはできません」とLessler氏は言います。
「これは、効果的な介入として学校閉鎖をサポートする重要なデータです」と、ジョンズ・ホプキンス・ブルームバーグ公衆衛生大学院の疫学者であるケイトリン・リバーズは、3月5日のツイートで述べました。

3/08
子供はSARS-CoV-2に影響をうけやすい(Children are susceptible to infection by SARS-CoV-2.)
Coronavirus Disease-19 Among Children Outside Wuhan, China 21 Pages Posted: 3 Mar 2020
Available at SSRN: https://ssrn.com/abstract=3546071
背景:コロナウイルス病-19(CoVID-19)の継続的な発生は、中国および他の多くの国で急速に患者数を増加させます。 CoVID-19に関する公開された記事は、成人の特性の報告に焦点を合わせていました。子供のデータは限られています。小児におけるCoVID-19の疫学的および臨床的特徴を明らかにすることを目指した。
方法:2020年1月16日から2020年2月19日までに深Shenzhen第三人民病院でSARS-CoV-2に感染した18歳未満の31例の確定症例を前向きに追跡しました。31例すべてがSARS-CoV-2であることが確認されましたリアルタイムRT-PCRによる上気道検体の分析。疫学的、人口統計学的、臨床的、臨床的、放射線学的プロファイルと治療結果が分析されました。
調査結果:31件すべてのケースで、Huananシーフードマーケットへの暴露はありませんでした。 29(93.5%)の子供が家族のクラスターにいます。 12人(38.7%)の子供には症状がなかった。 14人(45.2%)の子供に発熱が観察されました。発熱の期間は1〜9日でした(中央値:2 [IQR 1-3])。咳をした患者は13人(41.9%)でした。 17人の子供に正常範囲を超えるリンパ球が見られ、正常範囲を下回るリンパ球は見られませんでした。 12人(38.7%)の子供は、乳酸脱水素酵素レベルの上昇を示した。赤血球沈降速度の増加は、10人(32.3%)の患者で見られました。胸部CT画像は20例(64.5%)で正常であり、そのうちの1例は臨床経過の中で片側性肺炎になった。 8人(25.8%)の患者が片側性肺炎を示し、1人の患者が両側性肺炎の進行を示しました(表4)。 3人(9.7%)の患者に両側肺炎があった。 23人(74.2%)の子供が退院した。他の子供たちは無熱であり、彼らの臨床症状の重症度は低下しています。
解釈:子供はSARS-CoV-2に影響を受けやすい。私たちの予備的な発見は、子供たちが大人よりも攻撃性の低い臨床経過でより軽度の病気を発症することを示しています。

2020年3月6日金曜日

corona関連5

03/05


「湖北医療チームの新しいコロナウイルス感染症診断および治療プログラムのアーカイブ(試用版)」のハイライトは何ですか
http://rs.yiigle.com/yufabiao/1182687.htm
google翻訳
ウイルス(SARS-Cov-2)核酸RT-PCRテストは、SARS-CoV-2感染の診断の標準的な方法になりましたが、これらのリアルタイムPCRテストキットには多くの制限があります。さらに、高い偽陰性率が報告されました。多数の感染患者と無症候性キャリアを迅速に特定して、ウイルスの感染を防ぎ、患者の治療を確実に行うための正確で迅速な検査方法が急務であり、IgMを検出できる迅速で簡単なポイントオブケアラテラルフローイムノアッセイを開発
しましたIgG抗体は、15分以内にヒトの血液中のSARS-CoV-2ウイルスと同時に検出され、異なる感染段階の患者を検出できます。このテストキットを使用して、臨床研究を実施し、その臨床効果の使用を検証しました。この検査の臨床的検出感度および特異性は、3つのPCRで確認されたCOVID-19患者および8つの異なる臨床現場の128人の陰性患者から収集された血液サンプルを使用して測定されました。全体のテスト感度は88.66%で、特異度は90.63%でした。さらに、さまざまなタイプの静脈および指のスティックの血液サンプルから得られた臨床診断結果を評価しました。結果は、指のスティックの血液、血清、および静脈血の血漿からのサンプルの検出一貫性が優れていることを示しました。 。それは、病院、診療所、および検査室で、症候性または無症候性のSARS-CoV-2キャリアの迅速なスクリーニングに使用できます。

















03/05

池内有為 オープンサイエンスの効果と課題
https://www.jstage.jst.go.jp/article/jkg/70/3/70_140/_pdf/-char/ja 
新型コロナウイルスに関する研究データやプレプリントをはじめとする研究成果の迅速な共有,すなわちオープンサイエンスの取り組みが,研究者,助成機関,学術出版社,図書館などのステークホルダーの協力によって進められている。その最大の効果は,研究開発費や人的・物的資源,時間を効率的に活用し,研究を急速に進展させていることであるといえるだろう。(以上引用文)

Pradhan らが 1 月 31 日に bioRχiv に登録した“新型コロナウイルスに HIV ウイルスに類似したタンパク質が含まれている”とするプレプリント 20) は,研究者から内容に対する複数の批判的なコメントを受けた。さらに,フェイクニュースの根拠として使われ,拡散される事態に発展した。結果,Pradhan らは公開からわずか 2 日後の 2 月2 日にプレプリントを撤回した。以上上記論文の引用文

当初、私は新規コロナウイルスの影響は、中国内の公害も格差もなしえなかった共産主義政権への崩壊に繋がると考えた。しかし、現在では人類共通の敵である感染症を介して、国際協調の動き、諸国共存の肯定的な動きに連動しうるとも考えている。オリンピック開催にこだわらず、大胆な提言と実行力が開花すれば、そうした提言者、政治家は与野党の枠を超えて評価されることだろう。


2020年3月4日水曜日

corona関連4

03/01
○「新型コロナウイルス感染症 ~市民向け感染予防ハンドブック」賀来 満夫先生は長崎大学医学部のサッカー部の先輩で、とても優しい先輩でした。http://tmpuh.net/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B3%E3%83%AD%E3%83…  ハンドブックは、2月25日時点の情報に基づき作成


03/01
Report of the WHO-China Joint Mission
on Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Report
16-24 February 2020
https://www.who.int/…/who-china-joint-mission-on-covid-19-f…
Children
Data on individuals aged 18 years old and under suggest that there is a relatively low attack rate in this age group (2.4% of all reported cases). Within Wuhan, among testing of ILI samples, no children were positive in November and December o
f 2019 and in the first two weeks of January 2020. From available data, and in the absence of results from serologic studies, it is not possible to determine the extent of infection among children, what role children play in transmission, whether children are less susceptible or if they present differently clinically (i.e. generally milder presentations). The Joint Mission learned that infected children have largely been identified through contact tracing in households of adults. Of note, people interviewed by the Joint Mission Team could not recall episodes in which transmission occurred from a child to an adult.

18歳以下の個人に関するデータは、この年齢層の攻撃率が比較的低いことを示唆しています(報告されたすべての症例の2.4%)。 武漢では、ILIサンプルの検査の中で、2019年の11月と12月および2020年1月の最初の2週間に陽性の子供はいませんでした。 入手可能なデータから、また血清学的研究の結果がない場合、子どもの感染の程度、子どもが伝染で果たす役割、子どもの感受性が低いかどうか、または臨床的に異なって現れるかどうか(すなわち、一般に軽度の症状)を判断することはできません )。 合同ミッションは、感染した子供が大人の世帯での接触追跡を通じて主に特定されていることを学びました。 注目すべきは、共同ミッションチームがインタビューした人々は、子供から大人に感染が起こったエピソードを思い出せなかったということです。
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Team could not recall episodes という言及の根拠を知りたい

03/02
WHO Director-General's opening remarks at the media briefing on COVID-19 - 28 February 2020
こっちはわかりやすい。
過去24時間で、中国は329症例を報告しました。これは1か月以上で最低です。ジュネーブ時間の午前6時現在、中国は2791人の死亡を含むCOVID-19の合計78,959件をWHOに報告しています。中国以外では、49か国で4351件、67人が死亡しています。
昨日以来、デンマーク、エストニア、リトアニア、オランダ、ナイジェリアのすべてが最初の症例を報告しています。これらすべてのケースにはイタリアへのリンクがあります。イタリアから14か国に24ケースが輸出され、イランから11か国に97ケースが輸出されました。
過去数日間にわたる症例数の継続的な増加、および影響を受ける国の数は、明らかに懸念事項です。私たちの疫学者はこれらの進展を継続的に監視しており、現在、COVID-19の広がりのリスクと影響のリスクの評価を世界レベルで非常に高くしています。
現時点で私たちが目にしているのは、いくつかの国でCOVID-19の流行にリンクされていますが、ほとんどの症例は既知の接触者または症例の集団にまで遡ることができます。ウイルスがコミュニティで自由に広がっているという証拠はまだありません。それが事実である限り、症例を早期に検出し、患者を隔離してケアし、接触を追跡するための堅牢な措置が取られた場合、このウイルスを封じ込める可能性があります。
昨日言ったように、国によってシナリオは異なりますし、同じ国の中で異なるシナリオがあります。このウイルスを封じ込める鍵は、感染の連鎖を断つことです。昨日、私は、各国が症例に備え、今後の感染を防ぐためにしなければならないことについて話しました。
WHO-中国共同ミッションの報告書は現在、その報告書を公開しており、これはWHOのウェブサイトで英語で利用可能であり、また国家保健委員会のウェブサイトでも中国語で掲載されます。このレポートには、中国、影響を受ける国と影響を受けない国、国際社会、および一般市民向けの豊富な情報と22の推奨事項が含まれています。
これは、すべての国が人口を教育し、サーベイランスを拡大し、すべての症例を見つけ、隔離し、世話をし、すべての接触を追跡し、政府全体および社会全体のアプローチをとることを求めています。厚生省だけの仕事。
同時に、ワクチンと治療薬の研究も進んでいます。20以上のワクチンが世界的に開発されており、いくつかの治療薬が臨床試験中です。数週間のうちに最初の結果を期待しています。しかし、ワクチンや治療薬を待つ必要はありません。今日、すべての個人が自分自身や他の人を守るためにできることがあります。
あなたのリスクは、あなたが住んでいる場所、あなたの年齢、一般的な健康状態に依存します。WHOは一般的なガイダンスを提供できます。また、各国のガイダンスに従い、地元の医療専門家に相談してください。
ただし、知っておくべき10の基本事項があります。
まず、私たちが言い続けているように、アルコールベースの手で定期的に手をこするか、石鹸と水で手を洗ってください。汚染された表面や病気の人に触れた後に顔に触れることは、ウイルスが伝染する可能性のある方法の1つです。手をきれいにすることで、リスクを減らすことができます。
第二に、キッチンベンチや作業机など、消毒剤で定期的に表面をきれいにします。
第三に、COVID-19について教育します。情報が信頼できるソース(地元または国の公衆衛生機関、WHO Webサイト、または地元の医療専門家)からのものであることを確認してください。誰もが症状を知っている必要があります-ほとんどの人にとって、鼻水ではなく発熱と乾いた咳から始まります。ほとんどの人は軽度の病気にかかり、特別なケアを必要とせずに良くなります。
第4に、発熱や咳がある場合は旅行を避け、フライト中に病気になった場合はすぐに乗組員に知らせてください。帰宅したら、医療専門家と連絡を取り、どこに行ったかを伝えてください。
第5に、咳やくしゃみをする場合は、袖に入れるか、ティッシュを使用します。すぐにティッシュを閉じたゴミ箱に捨ててから、手をきれいにしてください。
第六に、60歳以上の場合、または心血管疾患、呼吸器疾患、糖尿病などの基礎疾患がある場合、重度の疾患を発症するリスクが高くなります。混雑したエリア、または病気の人とやり取りする可能性のある場所を避けるために、特別な予防策を講じることができます。
第七に、すべての人にとって、気分が悪いときは家にいて医師または地元の医療専門家に電話してください。彼または彼女はあなたの症状、あなたがどこにいたか、あなたが誰と接触したかについていくつか質問をします。これにより、適切なアドバイスが得られ、適切な医療施設に送られ、他の人への感染を防ぐことができます。
第8に、病気の場合は、家にいて、家族とは別に食事と睡眠をとり、別の道具やカトラリーを使用して食事をします。
9番目に、息切れが発生した場合は、医師に連絡してすぐに治療を受けてください。
そして第10に、特にあなたが影響を受けた国やコミュニティに住んでいる場合、不安を感じることは普通で理解できることです。コミュニティで何ができるかを調べてください。職場、学校、礼拝所で安全を保つ方法について話し合ってください。
一緒に、私たちは強力です。封じ込めはあなたから始まります。
現時点での最大の敵はウイルスそのものではありません。それは恐怖、噂、スティグマです。そして、私たちの最大の資産は、事実、理由、連帯です。
03/02

03/03
03/03
ウイルス粒子と、RNA strandと、蛋白(ウイルス増殖の為に寄生した細胞内でウイルスが産生させたモノ)の三者に乖離があり、これが感染性とPCR検査の乖離につながっている?アルコールなどによってウイルス粒子表面を壊しても、残ったRNA strandは感染性を再度獲得するかもしれない?提案的な論文でプレプリントです。以下紹介
Can the novel coronavirus transmit via RNAs without 1 protein capsids?
Short title: Novel coronavirus transmit via RNAs
Zhongneng Xu*1, 2, Shuichi Asakawa*2
Last edited: Feb 28, 2020 UTC
新規コロナウイルスは、1つのタンパク質カプシドなしでRNAを介して伝播できますか?
短いタイトル:RNAを介した新規コロナウイルスの伝達
中年徐* 1、2、浅川修一* 2
Zhongneng Xu、txuzn @ jnu.edu.cn、axuzhongneng @ mail.ecc.u-tokyo.ac.jp; 浅川修一、asakawa @ mail.ecc.u7 tokyo.ac.jp
済南大学生態学部、広州510632、中国; 2 東京大学大学院農学生命科学研究科水生生物科学部門、東京113-8657、日本
概要
新規コロナウイルス(SARS CoV 2)のいくつかの感染イベントのメカニズムは不明であり、伝送モードの新しいアイデアが奨励されます。本論文では、SARS-CoV-2 RNA の感染性が紹介されました。RNA感染の可能な説明には、SARS-CoV-2の複製およびその他の代謝プロセスを制御するRNA鎖、人から人へ伝染するのに十分なRNAの推定安定化時間、遊離RNAによって伝染する別の感染症の報告などが含まれますしたがって、さらなる研究が提案されました。環境におけるSARS-CoV-2 RNAとタンパク質の比率とSARS-CoV-2粒子におけるその比率との比較を行って、遊離RNAの存在を証明することができた環境内のウイルスのゲノム。ウイルス感染のリスクを評価し、RNA伝達の方向と起源を分析するには、空間内のRNA の濃度分布を検出する空間アレイ法を適用する必要があります。ウイルスRNA鎖とタンパク質の量が異なる患者の状態は、無症候性感染の現象を説明するための候補の理由の1つでした。SARS-CoV-2 RNAの感染性に基づいた、より厳しい保護対策が提供されました。この観点を証明する必要がありますが、いくつかの言及された研究提案と病気の広がりに対する保護対策は、他のウイルス性疾患やSARS-CoV-2の非RNA感染の状態に役立ちます。
キーワード= SARS-CoV-2、伝播、RNA、空間分布、無症候性感染
 致命的な新規コロナウイルスである重度の急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)の大量のヒトからヒトへの感染が確認されています[1-3]。感染は猛烈で、専門的な保護意識と優れた保護具を備えた多くの医療関係者でさえ感染しています。伝送の詳細の一部は不思議です。研究者らは、直接接触および液滴による伝播に加えて、糞便や涙などの患者の一部のアイテムでSARS-CoV-2核酸も発見しました[4-5]。さらに、この疾患の無症候性感染が報告されています[6]。多くの国では、最高レベルの感染症防御システムを有効にしていますが、SARS-CoV-2がコミュニティに広がるのを防ぐことはできません。既存の知識では感染イベントの現象の一部を説明できないことを示している可能性があり、伝送モードに関連する新しいアイデアが推奨されます。RNA鎖はSARS-CoV-2の唯一の遺伝物質であるため、タンパク質キャプシドなしで、あるホストから別のホストに移動し、転写と複製の活動を維持することができます。RNAの感染性は、SARS-CoV-2の感染経路の1つと見なすことができます。ここで、考えられる理由、さらなる研究提案、予防策を示しました。可能なメカニズム
RNAは、新規コロナウイルスの最も重要な材料です。宿主細胞に対するSARS53 CoV-2攻撃中、正のRNA鎖のみが細胞に入り、最終的に発現、遺伝物質の複製、ウイルス全体のアセンブリなどを通じて細胞を破壊します[7]。カプシド粒子はRNA鎖を保護し、宿主細胞膜受容体に結合して細胞を潜らせることができますが、RNAのないカプシド粒子には複製能力がありません。ただし、タンパク質シェルのない遊離RNA鎖が宿主細胞に入ることができる限り、SARS-CoV-2 粒子と同様に生物学的プロセスを完了することができます。コロナウイルスでは、正のRNA鎖をテンプレートとして使用して負のRNA鎖を生成し、負の鎖をテンプレートとして使用して正の鎖を複製します。プラス鎖とマイナス鎖の両方がmRNAを転写できます。mRNAからの遺伝情報で翻訳されたタンパク質は、正のRNA 鎖を被覆してウイルス粒子を形成します。したがって、コロナウイルス粒子を伴う正および負のRNA鎖は、感染者から放出されます。さらに、外のコロナウイルス粒子のタンパク質カプシド65 が破壊されると、RNAも環境にさらされます。
 SARS-CoV-2の遊離RNA鎖は、空中に浮遊する可能性があります。ウイルス粒子に比べ、新規コロナウイルスRNAは、空気中で容易にフロートです。新規コロナウイルスRNAゲノムは、いくつかのRNA配列と同様である30キロバイト[8]である他の生物の。新規コロナウイルスRNAゲノムの分子量は1×104 KDで、コロナウイルス粒子の分子量の約500分の1です。このサイズにより、SARS-CoV-2 RNAは沈降しにくくなり、安定性が許せばより長い距離にドリフトする可能性があります。大気環境における新規コロナウイルスRNA配列の安定性は大きな問題です。細胞内のRNAの寿命は通常数分から数日であり[9]、宿主細胞内のウイルスRNAは特定のタンパク質への結合などの何らかの手段による分解プロセスを回避します[10]。一部のRNA実験では、RNA は空気中で数分以上安定する場合があります。RNAを抽出するプロセスを例にとると、乾燥RNAは室温で10 分間、空気中で安定します。コロナウイルスのRNA鎖が空中でどれくらい長く生存できるかは不明ですが、場合によっては、新しいホストを見つけるのに数秒で十分な場合もあります。
 SARS-CoV-2 RNAが宿主細胞と接触する場合、細胞内にどのように侵入するかが重要な問題です。細胞は、エンドサイトーシスを介して、小さなウイルスやナノ粒子などの小さな粒子を細胞に飲み込むことができると報告されています[11-12]。したがって、新しい宿主の気道および消化管の表皮細胞は、エンドサイトーシスなどのプロセスを介してコロナウイルスRNAを細胞に飲み込む可能性があります。新規コロナウイルスRNAは、損傷部位から細胞に侵入したり、損傷した細胞の成分を使用してウイルス粒子を合成したりすることもできます。遊離RNAを介したいくつかの感染性病原体の伝播が報告されています。高等植物で病気を引き起こすウイロイドは、RNAを介して宿主細胞に感染する可能性があります[13]。これらの病原体は、タンパク質をコーティングせずにRNAのみです。新規コロナウイルスのRNAのように、ウイロイドは宿主細胞内で複製します。ウイロイドは小さな穴から植物細胞に侵入し[14]、SARS-CoV-2 RNAの侵入を可能にするヒト細胞内のチャネルを見つけることは、植物細胞内で見つけるよりも難しくないかもしれません。さらなる研究提案
 利用可能な新規コロナウイルスRNAのレベルと、環境中の遊離SARS-CoV-2 RNAの存在をどのように判断するかは、RNA伝達において重要な役割を果たします。生産および分解されたRNA鎖の量分析は、最初のステップです。細胞内の陽性RNAと陰性RNAの両方の量は変動すると考えられています[15]。細胞内で産生される新規コロナウイルスRNA 鎖には、いくつかの宛先があります。
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生成された総RNA鎖  =セル内のプラス鎖+セル内のマイナス鎖 + セル外のプラス鎖+ セル外のマイナス鎖  + セル内のコロナウイルス粒子内のプラス鎖  +コロナウイルス粒子内のマイナス鎖細胞  + 細胞外のコロナウイルス粒子内のプラス鎖  + 細胞外のコロナウイルス粒子内のマイナス鎖+分解されたプラス鎖+分解されたマイナス鎖
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 ウイルス粒子の内側と外側のRNA鎖は、分解されたものを除き、患者から放出されます。反逆者として、免疫細胞と抗体を使用してウイルスタンパク質と核酸を直接殺すことに加えて、宿主細胞は新規コロナウイルスRNA鎖の正常な複製を妨害する可能性もあります。したがって、放出可能なRNA 鎖の量は、複雑な要因の影響を受けます。環境中の遊離コロナウイルスRNAの存在をどのように判断するかは、本研究のアイデアを部分的に証明するための重要な質問です。環境内の新規コロナウイルスの核酸試験の陽性結果は、環境内に新規コロナウイルス粒子が存在することを証明するものではなく、コロナウイルスRNAの存在のみを示しています。場合さらに検出結果は、環境中のRNAの割合が高いことを示す、新規なコロナウイルス粒子中のRNAの割合よりも、それが示すかもしれない環境におけるSARS-CoVの-2の遊離のRNAゲノムの存在。
 感染性SARS-CoV-2 RNA鎖の時間的および空間的分布は、必要な研究内容です。一時的な問題の1つの側面は、RNA鎖の寿命です。宿主細胞と空気中の新規コロナウイルスRNA鎖の運命には大きな違いがあり、後者は未知のままです。時間的問題の別の側面は、RNA鎖の感染活動125です。負の相関関係、放物線の関係、時間の経過に伴う安定した感染活動など、感染活動とRNAの年齢との関係は複雑になる場合があります。外部環境の「死んだ」コロナウイルス粒子内のRNA鎖が破壊されない場合、RNA鎖の放出により事態はより複雑になります。分子量の大きな違いのため、空気中のRNA 鎖とウイルス粒子は、両方が同じダストまたは液滴に付着していない限り、異なる流体力学的軌道を持ちます。一般に、RNA 鎖の空間分布はより広くなります。RNA鎖とウイルス粒子の空間分布範囲がわかっている場合、SARS-CoV-2キャリアからの安全距離を推定できます。新規コロナウイルスRNAの空間分布を検出する方法を開発する必要があります。空間アレイ法と空気のろ過による測定を試すことができることをお勧めします。
 空間アレイ法を介して特定の空間で新規コロナウイルスRNAの空間分布を検出するには、一連の手順は次のとおりです:空間内の検出部位を設定→ ゲル、テストストリップ、溶液などのサンプリングメディアを追加RNA 保存液を各検出サイトに配置→ 要件に応じてサンプリングメディアの温度を制御→一定時間後、サンプルを収集してRNAレベルを検出→空間内のRNAの濃度分布を分析→ 方向と起源を分析RNA伝達の。空気ろ過法は、一定量の空気をろ過し、フィルター残留物中の新規コロナウイルスRNAレベルを決定することです。空気ろ過法の前提は、RNA分子をろ過できるろ過装置を見つけることです。空間配列法は詳細な固定小数点定量分析であり、空気ろ過法は比較的粗い定量分析です。
 無症候性感染のメカニズムを研究することは価値があります。感染と症状に関連する新規コロナウイルスの材料には、主にウイルス粒子、正のRNA鎖、負のRNA鎖、ウイルスタンパク質が含まれます。仮定RNA含有要素(ウイルス粒子、ポジティブRNA鎖、および負のRNAことストランド)は、感染性因子およびタンパク質含有要素(ウイルス粒子およびあるウイルスタンパク質)の症状を引き起こす要因です。感染者にとって、これらの要因の組み合わせのパターンは、その人が症状を持っているかどうかを決定します。たとえば、主に155の宿主細胞でRNA鎖の複製がある可能性があるため、キャリアは無症候性ですが、新規コロナウイルスRNA鎖を伝達できます。症状のパターン、ウイルスタンパク質およびウイルス粒子は大きいで産生される症候および感染患者で得られた、数字。数時間から数週間までの宿主における新規コロナウイルスの不規則な潜伏時間は、感染因子と症候因子の組み合わせのパターンに関する上記の仮定によっても説明されるかもしれません。さらに、新しいホストにさらされるウイルス粒子、正のRNA鎖、および負のRNA鎖の割合も、潜在時間に影響を与える可能性があります。
 一般に、新規コロナウイルス粒子は攻撃的なタンパク質を持っているため、RNAを宿主細胞に迅速に注入でき、ウイルス粒子は複製されて患者に症状を示すように誘導します。プラスのRNA鎖は、ウイルス合成プロセスを完了するのと似ていますが、細胞内にすぐには入らないはずです。マイナスRNA鎖の問題は、宿主細胞に入る方法だけでなく、複製する方法でもあり、転写や翻訳、複製を正しい順序で行うために長い時間や他の要因を待つ場合があります。したがって、宿主細胞の負のRNA鎖のみが、長い潜伏期間を引き起こす候補の1つです。
 RNA感染に関連する他の問題にも注意を払う必要があります。RNAやDNAを使用して人から人へ感染する他のウイルスが存在する場合があります。一般的な環境では、DNAはRNAでより安定であり、その後の可能性DNAウイルスおよびレトロウイルスからの感染性DNA鎖は価値研究です。このように、温度、湿度、空気の圧力などの環境要因の影響の安定性のようなウイルス核酸及び他の質問の送信処理水中のウイルスRNAは、考慮する必要があります。
予防策の提案
 上記は仮定にすぎませんが、これらが間違っていることが証明される前に、既存の防御手段を改善して病気のspread延を防ぐ必要があります。
 SARS-CoV-2の核酸検査は、正のRNA 鎖だけでなく、負のRNA鎖も標的にする必要があります。負のRNA鎖は新規コロナウイルス粒子には含まれていませんが、負の鎖は人が感染していることを確認でき、本研究で説明されているように伝染する可能性があります。185 核酸フィンガープリントと負のRNA鎖の完全な配列の検出は、環境での感染リスクの評価に役立ち、核酸検査での偽陰性結果を大幅に削減します。
 タンパク質を不活性化する消毒方法は、新規コロナウイルスRNAを破壊しない可能性があります。ウイルスタンパク質は侵襲的であり、新規コロナウイルスはその攻撃性を高めるエンベロープを持っています。薬用アルコールなどの一部の消毒剤によるウイルスおよびエンベロープのタンパク質タンパク質の変性は、常にウイルスを殺すと見なされます。ウイルスタンパク質とエンベロープのみを不活性化すると、実際に攻撃性が低下しますが、損傷したタンパク質を含む新規コロナウイルスは、RNA鎖が新規コロナウイルスの複製と代謝を制御するために必要な要素であるため、潜在的な生物学的活性と感染性がまだあります。したがって、新規コロナウイルスのRNA鎖を損傷する可能性のある消毒方法を使用することをお勧めします。
 感染者がSARS-CoV-2を送信できる空間的および時間的範囲は、以前に推定されたものよりはるかに大きい場合があります。新規コロナウイルスのキャリアからの感染の半径は数メートル以上であり、RNA鎖の寿命が許せば、感染の半径は時間とともに拡大し続けます。新規のコロナウイルス粒子と比較して、このウイルスの感染性RNA鎖は、より遠くに浮遊する可能性があるため、伝播のリスクが高く、群衆が集まると事態は悪化します。したがって、上記の空間アレイ法と空気ろ過法、または他の代替方法を使用して、混雑した場所での新規コロナウイルスRNAの空間分布を定期的に決定し、ウイルス感染のリスクを評価することをお勧めします。
 マスクなどの現在の抗感染デバイスは、RNA分子からの感染を防ぐことができない場合があります。マスクとフィルタリングガスマスクは、ほこりや水滴に付着した新規コロナウイルス粒子とRNA鎖のほとんどを除去できますが、空気中に浮遊する遊離RNAをフィルタリングすることは困難です。適切な解決策がない場合は、感染患者やウイルスキャリアと直接接触する必要がある人々に隔離された防毒マスクを適用する必要があります。
結論
 SARA-CoV-2がRNA鎖を使用して拡散するという考えは、ウイルス性疾患の感染メカニズムの研究に役立ち、実験的および臨床的検証が急務です。この観点に基づいて、より厳格な保護対策を開発する必要があります。これは、健康な人々を保護するのに意味があります。遊離ウイルスRNA が感染活動を維持するかどうかは興味深いものであり、生命の起源の問題に関連しています。RNAの場合、環境で生産される最初の遺伝物質が議論されます。私たちは、ウイルスRNAの感染については、この問題に関する更なる検討が多くの有用な情報につながると信じている。



2020年3月1日日曜日

corona関連3

02/29
COVID19の特徴的なCT所見は、円周状(HALO)のスリガラス陰影が線状浸潤像に変化していくこと。これが複数あればウイルス肺炎を疑うべき。
Correlation of Chest CT and RT-PCR Testing in Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) in China: A Report of 1014 Cases
https://doi.org/10.1148/radiol.2020200642 Published Online:Feb 26 2020
Figure 3:
02/29
消毒に関して、日、米(CDC)、WHO,欧州(ECDC)で共通しているのは、手などの皮膚の消毒を行う場合には、消毒用アルコール(70%)を、物の表面の消毒には次亜塩素酸ナトリウム(0.1%)が有効という原則。Povidone-iodine 10% (1% iodine) Glutaraldehyde 2%  Isopropanol 50% Benzalkonium chloride 0.05% Sodium chlorite 0.23% Formaldehyde 0.7% に関しては特に推奨していない。但し新型コロナウイルスを使って検証した報告などはない。
WHO
https://www.who.int/…/q-a-on-infection-prevention-and-contr…
○70% Ethyl alcohol to disinfect reusable dedicated equipment (e.g., thermometers) between uses
Sodium hypochlorite at 0.5% (equivalent 5000ppm) for disinfection of frequently touched surfaces in homes or healthcare facilities
厚労省
新型コロナウイルスに関するQ&A(医療機関・検査機関の方向け) 令和2年2月27日時点版
https://www.mhlw.go.jp/…/kenkou_…/dengue_fever_qa_00004.html
手などの皮膚の消毒を行う場合には、消毒用アルコール(70%)を、物の表面の消毒には次亜塩素酸ナトリウム(0.1%)が有効であることが分かっています。
欧州
https://www.ecdc.europa.eu/…/coronavirus-SARS-CoV-2-guidanc…
Interim guidance for environmental cleaning in non-healthcare facilities exposed to SARS-CoV-2 18 February 2020
02/28
感染者数に関しては他の国との比較は様々なバイアスがあって困難。各国が連携して感染株の比較をすれば流出入傾向や病原特性の違いも判断できる。また感染期に入ったなら、感染との戦いをどう変えるか検討しなければなりません。これまでの社会秩序、慣例や習慣を変更することも必要。政治家や各領域の権威には、そういった大胆な見通しを提言して欲しい。
02/27
コロナウイルス関連文献 CTに特徴的な所見
The Lancet Infectious Diseases
Available online 24 February 2020 https://www.sciencedirect.com/…/pii/S1473309920300864/pdfft…
Radiological findings from 81 patients with COVID-19 pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study
結論として、COVID-19肺炎は、肺CTスキャンで、気管支透亮造、不明瞭なマージン、および右下葉のわずかな優位性を伴う、両側性、胸膜下、すりガラス状の陰影として現れる傾向があります。異常な肺CT所見は無症候性の患者にも存在する可能性があり、病変は発症後1〜3週間以内にびまん性すりガラス状の不透明性優位または圧密パターンに急速に進展し、発症後約2週間でピークに達する。 COVID-19肺炎の患者の場合、フォローアップCTでの高齢、男性の性別、根本的な併存疾患、および進行性のX線写真の悪化が予後不良の危険因子である可能性があります。
Deep Learning System to Screen Coronavirus Disease 2019 Pneumonia
focal ground glass shadows
https://arxiv.org/pdf/2002.09334 
mainly distributed in bilateral lungs, multiple consolidation shadows accompanied by the "halo sign" of surrounding ground glass shadow in both lungs, mesh shadows and bronchiectasis and inflating signs inside the lesions, and multiple consolidation of different sizes and grid-shaped high-density shadows. However, it is not objective and accurate to distinguish COVID-19 from other diseases only with human eyes.
COVID-19のCTイメージングでは、主に両側肺に分布し、両肺の周囲の「halo sign」を伴うすりガラス陰影、複数の統合陰影、病変内のメッシュ陰影と気管支拡張症および膨張兆候、および異なるサイズと格子状の高密度陰影の複数の統合 。 しかし、COVID-19を他の病気と人間の目だけで区別することは客観的で正確ではありません。以下ディープラーニングシステムベースのスクリーンモデルの優位性に言及、この部分は略
Two Things about COVID-19 Might Need Attention
Xiaodong Jia * , Chengliang Yin , Shanshan Lu , Yan Chen , Qingyan Liu , Junfan Bai , Yinying Lu
Version 1 : Received: 22 February 2020 / Approved: 23 February 2020 / Online: 23 February 2020 (10:30:06 CET)
2019年の新規コロナウイルス病(COVID-19)の世界中への拡散は、公衆衛生にとって深刻な課題でした。人間のアンジオテンシン変換酵素2(ACE2)は、重度の急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)に非常に高い親和性の結合があります。ネットワークデータベースの検索とpublicデータの再分析により、脂肪組織のACE2発現レベルが肺組織のレベルよりも高いことがわかりました。脂肪細胞と脂肪前駆細胞によって発現されるACE2のレベルは、非肥満者と肥満者の間で類似していたが、肥満者はACE2発現細胞の数を増やすためにより多くの脂肪を持っている。 5つの異なるタイプの癌によって引き起こされる腫瘍組織でのACE2の発現は、隣接する組織での発現と比較して大幅に増加しました。したがって、COVID-19の発生中は、肥満の個人と5種類のがん患者により多くの注意を払う必要がある可能性があります。5種とはsquamous cell carcinoma and endocervical adenocarcinoma), PAAD (Pancreatic adenocarcinoma), READ (Rectum adenocarcinoma), KIRP (Kidney renal papillary cell carcinoma) and KIRC (Kidney renal clear cell carcinoma)
02/26
大御所ランセットのとある論文(COVID-19 3月末終息説)が中国製すぎる。Statistical Estimate of Epidemic Trend, Suggestions and Lessons for Public Safety from the 2019 Novel Coronavirus (COVID-19)  以下引用
図4では、中国軍が2020年2月4日以降に確認した数量の減少 湖北省の医師と地方の医療力と大量の医療用品。曲線適合モデルのモデルは、元のデータと非常に一致しています(相関係数またはSQRT(R2)>120.95)。適合モデルにより、流行病の将来の開発動向を予測することにより、 湖北省と全国にかかわらず、発生の変曲点が現れていることがわかります。もし 厳しい社会的統制と予防と統制の現状を維持し続けます 対策、そして突然の突然の発生はありません、確認された症例数全国および湖北省は着実に減少し続け、 中国全体でのCOVID-19の流行は、60日以内に完全に制御されます(図4)。から 湖北と全国の両方でモデル1、2、4を装着した場合、2020年2月27日に、 毎日の診断が大幅に削減されます。確認された症例の推定数は 3月末までに1日あたり100未満、湖北省で約75,000の症例が確認された およびモデル2から全国で90,000。結果は再開の参照を提供できます。 企業、学校、政府機関。データの分析が基づいていることに注意してください 検査室で確認された症例。2020年2月13日、中国疾病対策センター 予防公開された臨床診断症例、すなわち検査室が確認されていない症例ですが、 「新規コロナウイルス感染肺炎診断および治療プログラム(試してみる 第5版)」の国家管理局である国立保健局が発行 伝統的な漢方薬、「臨床診断」のケースは湖北省で追加されました。診断 基準は、肺炎の画像化特性を有する疑いのある症例であり、 患者が早期に標準治療を受けることができるように、図6の「ボトムライン思考」
写真の説明はありません。

02/24

「完全な感染防御 難しい」 政府専門家会議の見解全文  新型コロナウイルス

https://www.nikkei.com/article/DGXMZO56000670U0A220C2PE8000/?fbclid=IwAR3hgAbrXmrsuF0fuNEiKTy5KSh6gFCjOCdZ9-RkeqcdPjT7ha_BdXlT_wg
順当な発表、感染制御の専門家達は信頼できる。この後は、1終息に向かうのか越年周回するのか?2繰り返し感染の頻度や抗体産生の動態と抗体の意義(中和抗体と考えて良いのか)、3部署別の感染防御法(病院や老人・介護施設に限らず、各種施設、集会所、店舗、勤務先、通勤手段、他)4重症化の予測因子(性別、年齢、合併症、内服薬など)と重症化症例の治療ガイドライン、5新興感染症蔓延期における行政機関、インフラの機能維持、6出入国管理と検疫における変更点、7国際協調のありかた、オリンピック開催地の代替の可能性検討、以下延々と続く
02/24
新規コロナウイルスが、そのアウトブレイクの終息宣言が出来る立ちのものなのか、風邪症候群を引き起こす他のコロナウイルス(Human coronavirus 229E、NL63、HKU1 、OC43 )のように終息し難いものなのか、そこはまだ分からない。インフルエンザのように毎年訪れるようになるなら、国際社会は鎖国新時代を迎えることになる。あるいは、アビガンなどの新規有望治療薬が奏功し、ワクチン開発が成功すれば、毎年来ても、備えは出来る。
 現状では、PCR検査は限定され、治療薬もないし、酸素投与や人工呼吸器も、ウイルス肺炎を治すモノではないので、非常に心細い。
 診断できて入院して人工呼吸器を付けても肝心のウイルス肺炎の治療が出来ない。何十年か先なら酸素輸液や酸素透析の技術があるだろうが、いまは開発するものもいない。
02/24
新規コロナウイルスに関する私見、
1 小児の重篤例や垂直感染が見られにくいのは朗報。
2 暖かくなっても感染力が残存するようだと、鎖国新時代という国際社会を迎えることになる。
3 高齢者や呼吸器疾患合併症、ステロイド等の治療中の人には、極めて深刻な状態。
4 もう少しウイルス研究が進化すると、人工ウイルス作成の証拠隠滅も出来るようになる。 
今回も予防や予測の難しさを知ることになった。後出しじゃんけんでは何とでもいえる。
02/24
Potential role of inanimate surfaces for the spread of coronaviruses and theirinactivation with disinfectant agents https://doi.org/10.1016/j.infpip.2020.100044
コロナウイルスとその拡散に対する無生物表面の潜在的な役割消毒剤による不活化
少し読み込んだ続報
35年前の参考資料としてあげている研究の、結論として、生体外のコロナウイルスは、低温環境より、20度環境の方が中湿度(50%)低湿度(30%)よりも高湿度(80%)のほうが半減期が短い。但しそれはHCoVなので同じcoronaではあるがどこまで参考になるのかな。
で、最近の研究では、鉄やプラスチックやアルミニウムや紙などに付着したコロナウイルスに関して、消毒の方では、クロルヘキシジンジグルコ-ネイトは基本的に効果がないという、個人的に(アルコールでかぶれる私)は衝撃的な結論が見られた。塩化ベンザルコニウムはOK
病院で消毒に使う濃度のエタノール、次亜塩素酸ナトリウム、塩化ベンザルコニウムの消毒効果は十分。暖かい室温で、十分な加湿をして、換気循環をさせて、これらの消毒をすれば効果があると言うことだろう。
しかし、室内においても、換気十分でなく、定期消毒がなく、加湿もない、混雑した状況は、たくさんある。通勤列車、飲み屋で、高湿度、換気十分なところはみたことないし。暖かい春に出現しなかったと言うことは、暖かくなるまではきびしいのかな。

2020年2月22日土曜日

corona関連2

既に多くの感染者が地方レベルに拡散していると思われる(直感)。調査対象の10%が陽性であってもパニックにならない体制を確保して、各県大病院先着50名の従事者検査などでサーベイランスすべき。既存のサーベイランスシステムを使っても良い。風評被害を心配するレベルではない。
■The lancetではCOVID-19 Resource Centreを立ち上げ、COVID-19関連の同紙論文をオープンアクセスにしている。

https://www.thelancet.com/journals/landig/article/PIIS2589-7500(20)30026-1/fulltext

知っておくべき論文 N Engl J Med 2020; 382:727-733 DOI: 10.1056/NEJMoa2001017

別の概略論文のgoogle邦訳 Another Decade, Another Coronavirus February 20, 2020 N Engl J Med 2020; 382:760-762 DOI: 10.1056/NEJMe2001126

数十年ぶりに、人獣共通コロナウイルスが種を越えてヒト集団に感染しました。暫定的に2019-nCoVと呼ばれるこのウイルスは、中国の武漢で、シーフードやウェットマーケットにさらされている人で初めて確認されました。中国の公衆衛生、臨床、および科学コミュニティの迅速な対応により、臨床疾患の認識と感染の疫学の初期理解が促進されました。最初の報告では、人から人への感染は限定的または存在しなかったことが示されましたが、現在ではその程度の感染が発生していることがわかっています。他の2つの病原性ヒト呼吸器コロナウイルス(重症急性呼吸器症候群コロナウイルス[SARS-CoV]および中東呼吸器症候群コロナウイルス[MERS-CoV])によるアウトブレイクのように、2019-nCoVはしばしば重症の呼吸器疾患を引き起こします。1月24日現在、2020年には、800を超える症例が報告され、死亡率は3%でした(https://promedmail.org/。は新しいタブで開きます)。
現在ジャーナルで報告されているように、Zhu et al.2は2019-nCoVを特定し、特徴づけています。ウイルスゲノムの配列が決定されており、これらの結果は他のレポートと合わせて、SARS-CoVと75〜80%同一であり、いくつかのコウモリコロナウイルスとさらに密接に関連していることを示しています3.同じ細胞内で増殖できますSARS-CoVおよびMERS-CoVの成長には有用ですが、特に、SARS-CoVやMERS-CoVとは異なり、2019-nCoVは標準の組織培養細胞よりも初代ヒト気道上皮細胞でよりよく成長します。ウイルスの同定により、この新しいコロナウイルス感染に関する重要な未知の問題に対処し、抗ウイルス療法の開発を導く試薬の開発が可能になります。まず、ゲノムの配列を知ることにより、ウイルスを迅速に検出するための高感度の定量的逆転写酵素-ポリメラーゼ連鎖反応アッセイの開発が促進されます。第二に、血清学的アッセイの開発により、ヒトや、湿った市場やその他の環境における潜在的な人獣共通感染源の感染率の評価が可能になります。湿潤市場は中国全土に存在するため、これらの試薬は人間の感染が当初考えられていたよりも広範囲に及ぶかどうかを評価するのにも役立ちます。第三に、ウイルスを手に持つことは、抗ウイルス療法とワクチン、および実験動物モデルの開発に拍車をかけるでしょう。
この感染についてはまだ多くを学ぶ必要があります。最も重要なことは、人間間の伝播の程度と臨床疾患の範囲を決定する必要があることです。 SARS-CoVおよびMERS-CoVの伝播は、スーパースプレッドイベントによって大幅に発生しました4,5。スーパースプレッドイベントは2019-nCoVの伝送に関係していますが、それらの相対的な重要性は不明です。 SARS-CoVとMERS-CoVは両方とも、上気道の細胞よりも肺内上皮細胞に多く感染します4,6。その結果、伝播は主に軽度の非特異的徴候のある患者ではなく、既知疾患の患者から起こります。 2019-nCoVはSARS-CoV(ヒトアンジオテンシン変換酵素2 [hACE2])3と同じ細胞受容体を使用しているようであり、3下気道疾患の徴候が発現した後にのみ伝播が予想されます。 SARS-CoVは2002年から2004年にかけて流行し、その細胞受容体によりよく結合し、ヒト細胞での複製を最適化し、毒性を増強しました。 。対照的に、MERS-CoVは2012.8で検出されて以来、ヒトの感染性を高めるために実質的に変異していません。
2019-nCoVは、SARS-CoVのように振る舞い、hACE2への結合が強化され、人間のホストにさらに適応する可能性があります。したがって、ウイルスが変異している程度を評価し、これらの変異がヒト宿主への適応を示しているかどうかを評価するために、できるだけ多くの時間的および地理的に無関係な臨床分離株を取得することが重要です。さらに、2019-nCoVがSARS-CoVに類似している場合、ウイルスは全身に拡散します9。剖検で患者のサンプルを採取することにより、感染の病因を解明し、治療的介入を合理的に修正できます。また、実験動物の実験感染から得られた結果の検証にも役立ちます。
2番目の重要な質問は、ウイルスの人獣共通感染源の特定です。コウモリのコロナウイルスとの類似性が高いことを考えると、コウモリはウイルスの主要な貯蔵所である可能性が高いです。 SARS-CoVは湿った市場の外来動物からヒトに伝染しましたが、MERS-CoVはラクダからヒトに伝染しました10。どちらの場合も、先祖の宿主はおそらくコウモリでした。 2019-nCoVをコウモリから直接送信するか、中間ホストを使用して送信するかを理解することは重要であり、人獣共通感染パターンの定義に役立ちます。

「アビガン」を新型コロナ治療に使えるか検討,その背景論文の一つ 
Therapeutic options for the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)

四つの非構造蛋白(スパイク蛋白など)を解析し、drug binding pocketを知り、既存の候補薬を使うことで安全性試験をクリアできスピードアップできる。抗マラリヤ薬の有効性報告も気になる。

Overlapping and discrete aspects of the pathology and pathogenesis of the emerging human pathogenic coronaviruses SARS‐CoV, MERS‐CoV, and 2019‐nCoV

https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/…/10…/lam.13285
病理学の重複した個別の側面と新生ヒト病原体の病因コロナウイルスSARS-CoV、MERS-CoV、および2019-nCoV  このミニレビューでは、SARS-CoVの病理と病因について簡単に紹介し、MERS-CoV、および新たに特定された2019-nCoVにこの知識を外挿します
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新たな大災害に対処しようとする場合、どの分野の権威に相談すべきか分からず、分かったとしても、その道の最高の権威も間違うかもしれない(実際に間違った例も少なくない)。そうした状況での政府の判断が必要だが、他国との戦争ではないのだから、民主的競争的協議が好ましい。
1 過去に例が少なく、危険性や重篤さについて、その大枠の経過の変遷を予測できない。(新興感染症は推移予測が困難)
2 解決必要な問題点が複数あり、それらの優先度や、相談すべき専門家への信頼性も判断できない。(問題の複雑性、課題のトリアージ)
3 個人情報保護や国家機密などの問題があり、集団的な協議をする上で、どの程度の情報公開が許されるのかが分からなかった。(民主的協議と機密保護のトレードオフ)
4 事後にオリンピックなどを控えており、欧米選手団が訪日を見送る場合、中国との親密さを演出して訪日選手団をかさ上げする政治的打算が働いていた。(国際的覇権の推移、中国カード)
コロナウイルス研究と、感染制御実務と、感染治療の専門家を兼ねている人はいません。

Transcending the Human-Centered View of Mind Through the Lens of Life-Extension Entities

 The Kurokawa Consciousness Theory — Transcending the Human-Centered View of Mind Through the Lens of Life-Extension Entities What is consci...