corona関連

https://www.nature.com/arti…/s41586-020-2008-3_reference.pdf

SARSやZikaなどの新興感染症は、国民に大きな脅威をもたらします健康1 –3。激しい研究努力にもかかわらず、新しい病気がどのように、いつ、どこで現れるかまだかなりの不確実性の原因です。重度の呼吸器疾患は中国湖北省武漢市で最近報告されました。1月25日まで2020年、最初の患者が入院して以来、少なくとも1,975人の症例が報告されています2019年12月12日。疫学的調査により、アウトブレイクは武漢のシーフード市場に関連していた。私たちは一人の患者を研究しました市場の労働者であり、26日に武漢中央病院に入院した2019年12月の発熱を含む重度の呼吸症候群を経験している、めまいと咳。メタゲノムRNAシーケンス4気管支肺胞洗浄体液サンプルは、設計されたコロナウイルス科からの新規RNAウイルスを同定しました。ここではWH-Human-1コロナウイルスとして。完全なウイルスゲノムの系統解析（29,903ヌクレオチド）ウイルスが最も密接に関連していることが明らかになりました（89.1％ヌクレオチド類似性）SARS様コロナウイルス（ベータコロナウイルス属、中国のコウモリから以前に採取されたサルベコウイルス亜種）。この発生深刻な病気を引き起こす動物からのウイルス流出の継続的な能力を強調しています

Clinical characteristics of novel coronavirus cases in tertiary hospitals in Hubei Province.
Chin Med J (Engl). 2020 Feb 7. doi: 10.1097/CM9.0000000000000744.
https://journals.lww.com/cmj/toc/9000/00000


The global spread of 2019-nCoV: a molecular evolutionary analysis
https://www.tandfonline.com/…/pdf/10.…/20477724.2020.1725339?
2019-nCoVの世界的な広がりは継続しており、WHOがリスク評価を高くすることで示されているように、急速に動いています。この記事では、この新しいウイルスの系統学的および系統地理学的な予備分析を提供します。 2019-nCoVの29の利用可能な全ゲノム配列と、GeneBankで利用可能なBat SARSのようなコロナウイルスからの非常に類似した配列である2つの全ゲノム配列を使用して、Maximum Clade Credibilityツリーが構築されました。私たちは、患者から2019-nCoV配列分離株を提供した国の間での感染のメカニズムを明らかにすることができます。 Bayesianの系統地理学的再構成は、2019〜2020年のnCoVが、恐らくRhinolophusのコウモリファミリーで循環しているBat SARSのようなコロナウイルスに由来することを示しています。疫学的観察と一致して、新しい発生の最も可能性のある地理的起源は中国の武漢市であり、分子時計分析によれば、2019年11月25日頃に、最新の共通祖先の2019-nCoV時間が出現しました。これらの結果、 一緒に
以前に記録された流行は、ベータコロナウイルスによる周期的な流行の発生の繰り返しパターンを示唆しています。さらに、私たちの研究は、SARS 2003の流行の根底にある同じ集団の遺伝的動態を記述し、動物とコウモリ科のRhinolophus間のBetacoronavirusの効果的な分子監視戦略の開発の緊急の必要性を示唆しています。


症例検討https://pubs.rsna.org/doi/pdf/10.1148/radiol.2020200330
Use of Chest CT in Combination with Negative RT-PCR Assay for the 2019 Novel Coronavirus but High Clinical Suspicion
Chest CT showed multiple peripheral ground-glass opacities in both lungs with more involvement of the left upper lobe, lingular segment. At admission, the real-time fluorescence polymerase chain reaction (RT-PCR) assay of the sputum was negative for the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) nucleic acid.Repeat CT chest performed 3 days after admission showed transformation of ground-glass opacities to more consolidation (Figure d–f ). A repeat RT-PCR 2019-nCoV nucleic acid assay was also negative at this time. Six days after admission, the third RT-PCR 2019-nCoV nucleic acid assay was finally found to be positive.
When specimen tests are negative, the possibility of a false-negative result should be considered in the context of a patient’s recent exposures and the presence of clinical signs and symptoms consistent with 2019-nCoV infection (1,2). In this case, chest CT findings were typical of findings for 2019-nCoV pneumonia (3) coupled with recent exposure suggesting that 2019-nCoV infection was likely
https://pubs.rsna.org/doi/pdf/10.1148/radiol.2020200330


https://www.biorxiv.org/…/10.1…/2020.02.08.939553v1.full.pdf
https://doi.org/10.1101/2020.02.08.939553
概要
2019年の新型コロナウイルス（2019-nCoV）の発生は、中国の武漢から複数の国に急速に広がり、驚異的な数の感染と死亡を引き起こしています。 2019-nCoVの免疫脆弱性ランドスケープの体系的なプロファイリングは不足しており、免疫クリアランスメカニズム、ペプチドワクチン開発、および抗ウイルス抗体開発に重要な洞察をもたらすことができます。 この研究では、すべての2019-nCoVウイルスタンパク質がクラスIおよびII MHC提示を誘導し、線形抗体エピトープを形成する可能性を予測しました。 T細胞とB細胞のエピトープの濃縮はウイルスゲノム上で均一ではなく、豊富なエピトープを生成し、よりターゲットを絞ることができるいくつかの焦点領域を示しました。 2019-nCoVの遺伝的変異は、現時点では少ないものの、関連するコロナウイルスの変異のパターンに既に従っており、治療法の開発で考慮すべきこのウイルスの免疫脆弱性の状況を変える可能性があることを示しました。 オンラインデータベースを作成して、研究成果を広く共有しています。 全体として、2019-nCoVの免疫学的リソースを提示します。これは、治療薬の開発と機械的研究の両方を大幅に促進する可能性があります。